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xuelinglei

新虫 (初入文坛)

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[交流] 【求助】g03指定分子片段的电荷与自旋多重度已有3人参与

g03说明书上有指定分子的电荷与自旋多重度，在分子说明部分，但怎样指定分子片段的电荷与自旋多重度？请教了，感谢所有参与者！

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1楼 2010-11-16 09:41:59

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ykwang

金虫 (正式写手)

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引用回帖:

Originally posted by xuelinglei at 2010-11-16 16:43:02:
请问例子里X,1,1.,2,X3O 与 X,2,1.,1,52.5,3,180.,0两行什么意思？另外怎么还有H7 H8?
例子与一般的Z-matrix不一样，前三行还能看懂，后面的就没看懂，例子输入坐标如下，请耐心指教，谢谢！
0,1,0,3,1,2
...

注意，在写Z-矩阵时为了方便常引入“虚”原子（Dummy Atom），符号规定为X。所以“X, 1, 1., 2, X3O” 描述的是第一虚原子，“X, 2, 1., 1,52.5,3,180.,0”描述的是第二个虚原子。由于该例中有两个H2O分子，再加两个虚原子X，故总的原子数是8个，自然可以有H7和H8存在。此外，该例前三行好懂，后面的就是标准Z-矩阵的格式，只不过在二面角之后多写一个0而已。
如果你看不懂英文，可找一本中文的Gaussian手册（小木虫上好像有，你搜一搜）。

此外，这种指定方式仅用于BSSE的计算。如果你的目的不是计算BSSE，这对你又有什么用呢？

[ Last edited by ykwang on 2010-11-16 at 17:38 ]