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husnjls

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】找过渡态的时候整个催化剂跑掉

在找一个过渡态的时候，催化剂会彻底跑开，但我要找的并不是催化剂脱去形成产物的那个过渡态；请问有没有人碰到过这样的问题，是不是可以考虑催化剂先脱去然后又配上的情况？
或者是因为催化剂和反应物之间位阻太大？
可不可以改变一些输入文件来解决？
请高手多给些建议和看法
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1楼 2010-11-10 10:35:05
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manson1998

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by husnjls at 2010-11-10 11:20:15:
不知道我的方法可不可行
就是把前一步的中间体优化完成的结构放到hyper里面，然后把即将成键的两个原子连上，用里面的优化方法优化然后中途断开，再按照自己猜测的结构调整一下，再用高斯找过渡态，很多时候经常 ...

嘿嘿 不是有qst2 qst3么
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4楼2010-11-10 12:23:29
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manson1998

金虫 (著名写手)
★
husnjls(金币+1): 2010-11-10 11:23:26
zhou2009(金币+1): 2010-11-10 11:26:08
很简单 因为你的初始模型不对。
可能是催化剂与反应体系相隔太远，也可能是位阻作用，具体的看不到你的模型也说不清。
至于如何构建TS的初始模型，还是从优化中间体开始吧。
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2楼2010-11-10 11:08:07
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husnjls

金虫 (小有名气)

回复

不知道我的方法可不可行
就是把前一步的中间体优化完成的结构放到hyper里面，然后把即将成键的两个原子连上，用里面的优化方法优化然后中途断开，再按照自己猜测的结构调整一下，再用高斯找过渡态，很多时候经常出问题，但自己猜测过渡态结构又没那个水平
赞一下 回复此楼
3楼2010-11-10 11:20:15
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