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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【讨论】schrodinger MacroModel 中的eMBrAcE minimazition
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xbjyccnu

银虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】schrodinger MacroModel 中的eMBrAcE minimazition 已有2人参与

schrodinger MacroModel 中的eMBrAcE minimazition 用来对对接后的构象算能量，结果看哪项的值呀？是Potential energy-OPLS-2005,还是MBAE Del Total energy-OPLS-2005？
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1楼 2010-11-09 12:48:36
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jumper158

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
用薛定谔作同源模建？楼主真牛
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游走于牛A与牛C之间，谁的青春不苦憋
2楼2010-11-13 19:29:16
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xbjyccnu

银虫 (小有名气)
★
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-11-14 08:49:32
引用回帖:
Originally posted by jumper158 at 2010-11-13 19:29:16:
用薛定谔作同源模建？楼主真牛

？？macromodel不是做同源模建的吧
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3楼2010-11-13 20:09:43
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jumper158

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-11-16 14:01:05
引用回帖:
Originally posted by jumper158 at 2010-11-13 19:29:16:
用薛定谔作同源模建？楼主真牛

MacroModel: 基于力场模建的黄金标准。可处理体系包括有机化合物、糖、核酸、小肽、蛋白等。在研究蛋白-配体的复合物，允许活性位点充分的柔性，而其他的地方刚性。
哈哈，不好意思，
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游走于牛A与牛C之间，谁的青春不苦憋
4楼2010-11-15 20:59:29
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jumper158

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我对薛定谔只懂glide，呵呵，无能为力了
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游走于牛A与牛C之间，谁的青春不苦憋
5楼2010-11-15 21:00:43
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