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tzwxc

金虫 (小有名气)

[交流] 【请教】请教一个A类错误的解决办法

A类错误：
PLAT601_ALERT_2_A Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .     678.00 A**3
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1楼 2010-11-06 21:47:58
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cfocus20

至尊木虫 (职业作家)
★
帝夫(金币+1):谢谢回帖交流 2010-11-07 22:22:58
有溶劑進行sqeeze指令
請將filename.sqz 這裡面數據複製到filename.cif最後面即可
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Smart_work_and_beautiful_life!
2楼2010-11-07 02:34:20
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linhua0402313

版主 (文坛精英)
★
tzwxc(金币+2): 2010-11-07 22:07:14
帝夫(金币+1):谢谢回帖交流 2010-11-07 22:23:04
通常这种错误提示要注意两种情况：
1. 有可能你的结构解析不完整，也就是结构当中存在一些小分子（溶剂分子水或DMF等）
2. 可能是你的结构中确实有空洞存在，这样你可以做相应的解释就OK了。

因此建议楼主好好检查结构，判断到底是那种情况导致的错误提示。
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身在高山独抚琴，心随流水会知音
3楼2010-11-07 08:16:09
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djp005

木虫 (正式写手)
帝夫:谢谢回帖交流 2010-11-07 22:23:08
我的结构好想也出现了一个这样的错误，出现了一个氧氧氢键，谁能帮忙解释一下吗
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4楼2010-11-07 22:00:04
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tzwxc

金虫 (小有名气)
1.用sqeeze是在planton里吗？
2.出现这类错误影响论文的发表吗？
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5楼2010-11-07 22:29:19
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djp005

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by tzwxc at 2010-11-07 22:29:19:
1.用sqeeze是在planton里吗？
2.出现这类错误影响论文的发表吗？

我听师兄说会影响论文的发表，我对这方面还不是特别熟悉
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6楼2010-11-07 22:34:51
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
Originally posted by tzwxc at 2010-11-07 22:29:19:
1.用sqeeze是在planton里吗？
2.出现这类错误影响论文的发表吗？

你用了squeez处理吗？

如果没有，应首先试着想办法把残余峰加成合理的客体分子。
如果残余峰比较小，比较乱，则再考虑做squeez处理。

如果已经做squeez处理，则按楼上说的，并在refine-special中加以说明，这是允许的。一般并不影响发表。
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xi2004-emuch@163.com
7楼2010-11-07 22:52:46
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zhengchenx

禁虫 (著名写手)
本帖内容被屏蔽
8楼2010-11-07 22:59:27
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