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tristan9362银虫 (初入文坛)
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【求助】Nose hoover chain 的code问题(希望写过NHC的可以路过指教一下)
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本人在按照molecular physics 1996 87 1117写NHC的时候看到其中用了call shake,这个是必须要用吗,主要是Daan Frenkel 的Molecular Simulation书里case 13的附注没有提这件事 现在我的结果仍是一个环,能量也不守恒 我写的思路是这样的(和文献一样): 定义初始的位移,动量,热浴的位移,动量 体系是一个simple harmonic oscillator 第一个dt/2 循环, 然后是velocity verlet 跟新位移和动量 第二个dt/2循环 如果需要的话,我可以贴出code,或者大家讲一下注意点也可以。。 |
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