Originally posted by 老虎大王 at 2010-10-31 12:38:05:
系综不同的话，有些热力学性质的统计方法是不一样的。实际上书上给出的多数统计公式，都是对NVE系综而言的，也有NVT的，在NPT下直接统计的情况不多。比如著名的书《The Art of Molecular Dynamics Simulation》， ...

Originally posted by shengxiang at 2010-11-01 23:31:33:


你说的挺透彻的，我是新手，这下记住了~~~谢谢你

Originally posted by 老虎大王 at 2010-11-02 08:07:19:



补充一点，对于多数热力学函数本身，不同系综导致的统计平均的差异在数值上相差并不大，但当计算热力学性质的均方时，不同系综下就会区别较大了。当然它们也是有联系的。你可以看这篇文章：Phys.Rev. 153:2 ...

Originally posted by shengxiang at 2010-11-02 08:30:43:


像MSD，RDF这样的函数的话在NPT系综下跑出来的可靠吗？不同的系综对结构信息没有影响吧？

Originally posted by 老虎大王 at 2010-11-02 10:33:49:



你这个问题就问到点子上了。

你是否研究过RDF的计算公式？里边的体积是一个定值，但是NPT系综下的V不是定值，全部的问题就在这里。问题不在于NPT系综下的原子位置可否用来计算RDF，而是在于你如何修正这 ...

Originally posted by shengxiang at 2010-11-02 14:38:19:


谢谢你详细的解答，让我受益匪浅，刚才提到了在RDF中存在体积的问题，RDF的计算公式我看过，我想问的问题是，假如我初始时一个5的立方盒子，体系中有两种物质，在动力学结束之后，其中一种物质发生了聚集，在 ...

Originally posted by 老虎大王 at 2010-11-03 07:57:30:


这个问题，问得不是很清楚啊。一般来讲，如果你模拟的是bulk物质，使用周期性边界条件，盒子的体积就是你模拟对象的体积，如晶体、溶液等。但如果你模拟的是孤立的分子，或者原子团簇之类，那情况就不是这样。