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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【讨论】系综问题
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老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-11-03 12:37:25
引用回帖:
Originally posted by shengxiang at 2010-11-03 08:13:36:


是这样的，在开始建立的时候溶液中两种物质是随意分布的，有周期边界条件，模拟结束后成了分子团簇了~

这种情况，我严重怀疑你的势函数有问题。
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21楼2010-11-03 10:57:00
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shengxiang

木虫 (著名写手)
★
zh1987hs(金币+1):鼓励交流 2010-11-06 14:32:39
引用回帖:
Originally posted by 老虎大王 at 2010-11-03 10:57:00:



这种情况，我严重怀疑你的势函数有问题。

不是吧？其中有一种物质可以形成大量的氢键，他们依靠氢键作用到一起的~
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22楼2010-11-04 21:43:22
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老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-11-06 14:32:22
引用回帖:
Originally posted by shengxiang at 2010-11-04 21:43:22:



不是吧？其中有一种物质可以形成大量的氢键，他们依靠氢键作用到一起的~

哦。如果是团簇，这个团簇的体积与盒子的体积一般来说不是一回事。
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23楼2010-11-05 16:33:00
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abinitio

版主 (著名写手)
★
shengxiang(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
16楼: Originally posted by 老虎大王 at 2010-11-02 10:33:49
你这个问题就问到点子上了。

你是否研究过RDF的计算公式？里边的体积是一个定值，但是NPT系综下的V不是定值，全部的问题就在这里。问题不在于NPT系综下的原子位置可否用来计算RDF，而是在于你如何修正这个 ...

感谢 @老虎大王
如果使用NPT系综，我如果计算每个温度下的rdf就使用每个温度下的体积，这种算法是否可以接受？
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24楼2013-06-06 22:35:02
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老虎大王

木虫 (著名写手)
引用回帖:
24楼: Originally posted by abinitio at 2013-06-06 22:35:02
感谢 老虎大王
如果使用NPT系综，我如果计算每个温度下的rdf就使用每个温度下的体积，这种算法是否可以接受？...

嗯。其实就是一个如何考虑体积变量的问题，以及如何求平均的问题。
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25楼2013-06-08 19:05:13
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tim562944200

金虫 (小有名气)
★
shengxiang(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
4楼: Originally posted by dellus at 2010-10-31 09:27:27
当然可以采用一种系综进行模拟
各种系综之间原则上是等价的，例如，在一个简单体系，采用NVT计算出P0，再把这个P0放入NPT进行计算V，NVT中采用的V0应该在NPT得到V的error bar之内。这个是一个重要的检查程序对错的 ...

请问 在NPT和NVT中模拟气液分象问题有什么不同?按您说的 在NVT中会形成相界面,在NPT中不会有界面吗,产生这种不同的原因是什么呢?  如果想计算界面张力只能在NvT中进行模拟吗?
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26楼2013-12-16 11:22:28
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LoogCat

铁虫 (小有名气)
★
shengxiang(金币+1): 谢谢参与
楼主还在人间不？能不能提供一些先npt再nvt的文献啊，我打算这么干，可是没有理论支持，跪求啊
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27楼2014-07-16 17:30:41
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g0701zz

新虫 (初入文坛)
★
shengxiang(金币+1): 谢谢参与
是用什么软件模拟吗
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28楼2015-04-25 18:26:49
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郭童鞋

新虫 (初入文坛)
★
shengxiang(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
4楼: Originally posted by dellus at 2010-10-31 09:27:27
当然可以采用一种系综进行模拟
各种系综之间原则上是等价的，例如，在一个简单体系，采用NVT计算出P0，再把这个P0放入NPT进行计算V，NVT中采用的V0应该在NPT得到V的error bar之内。这个是一个重要的检查程序对错的 ...

如果是求解高聚物材料的力学性能呢？是用NPT呢还是NVT呢？我分别使用一遍，计算结果相差很大啊？求解？
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29楼2015-10-10 16:44:30
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Awcse

新虫 (小有名气)
★
shengxiang(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
16楼: Originally posted by 老虎大王 at 2010-11-02 10:33:49
你这个问题就问到点子上了。

你是否研究过RDF的计算公式？里边的体积是一个定值，但是NPT系综下的V不是定值，全部的问题就在这里。问题不在于NPT系综下的原子位置可否用来计算RDF，而是在于你如何修正这个 ...

你好，请问一下，如果我计算MSD的话可以使用NVE系综吗？在固体当中的，为看文献上面多采用的是NVT系综不知道是为什么希望您能给我解答
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30楼2016-01-13 20:53:35
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