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老虎大王

木虫 (著名写手)

★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-11-03 12:37:25
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Originally posted by shengxiang at 2010-11-03 08:13:36:


是这样的,在开始建立的时候溶液中两种物质是随意分布的,有周期边界条件,模拟结束后成了分子团簇了~

这种情况,我严重怀疑你的势函数有问题。
21楼2010-11-03 10:57:00
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shengxiang

木虫 (著名写手)


zh1987hs(金币+1):鼓励交流 2010-11-06 14:32:39
引用回帖:
Originally posted by 老虎大王 at 2010-11-03 10:57:00:



这种情况,我严重怀疑你的势函数有问题。

不是吧?其中有一种物质可以形成大量的氢键,他们依靠氢键作用到一起的~
22楼2010-11-04 21:43:22
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老虎大王

木虫 (著名写手)

★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-11-06 14:32:22
引用回帖:
Originally posted by shengxiang at 2010-11-04 21:43:22:



不是吧?其中有一种物质可以形成大量的氢键,他们依靠氢键作用到一起的~

哦。如果是团簇,这个团簇的体积与盒子的体积一般来说不是一回事。
23楼2010-11-05 16:33:00
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abinitio

版主 (著名写手)


shengxiang(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
16楼: Originally posted by 老虎大王 at 2010-11-02 10:33:49
你这个问题就问到点子上了。

你是否研究过RDF的计算公式?里边的体积是一个定值,但是NPT系综下的V不是定值,全部的问题就在这里。问题不在于NPT系综下的原子位置可否用来计算RDF,而是在于你如何修正这个 ...

感谢 @老虎大王
如果使用NPT系综,我如果计算每个温度下的rdf就使用每个温度下的体积,这种算法是否可以接受?
24楼2013-06-06 22:35:02
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老虎大王

木虫 (著名写手)

引用回帖:
24楼: Originally posted by abinitio at 2013-06-06 22:35:02
感谢 老虎大王
如果使用NPT系综,我如果计算每个温度下的rdf就使用每个温度下的体积,这种算法是否可以接受?...

嗯。其实就是一个如何考虑体积变量的问题,以及如何求平均的问题。
25楼2013-06-08 19:05:13
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tim562944200

金虫 (小有名气)


shengxiang(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
4楼: Originally posted by dellus at 2010-10-31 09:27:27
当然可以采用一种系综进行模拟
各种系综之间原则上是等价的,例如,在一个简单体系,采用NVT计算出P0,再把这个P0放入NPT进行计算V,NVT中采用的V0应该在NPT得到V的error bar之内。这个是一个重要的检查程序对错的 ...

请问 在NPT和NVT中模拟气液分象问题有什么不同?按您说的 在NVT中会形成相界面,在NPT中不会有界面吗,产生这种不同的原因是什么呢?  如果想计算界面张力只能在NvT中进行模拟吗?
26楼2013-12-16 11:22:28
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LoogCat

铁虫 (小有名气)


shengxiang(金币+1): 谢谢参与
楼主还在人间不?能不能提供一些先npt再nvt的文献啊,我打算这么干,可是没有理论支持,跪求啊
27楼2014-07-16 17:30:41
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g0701zz

新虫 (初入文坛)


shengxiang(金币+1): 谢谢参与
是用什么软件模拟吗
28楼2015-04-25 18:26:49
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郭童鞋

新虫 (初入文坛)


shengxiang(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
4楼: Originally posted by dellus at 2010-10-31 09:27:27
当然可以采用一种系综进行模拟
各种系综之间原则上是等价的,例如,在一个简单体系,采用NVT计算出P0,再把这个P0放入NPT进行计算V,NVT中采用的V0应该在NPT得到V的error bar之内。这个是一个重要的检查程序对错的 ...

如果是求解高聚物材料的力学性能呢?是用NPT呢还是NVT呢?我分别使用一遍,计算结果相差很大啊?求解?
29楼2015-10-10 16:44:30
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Awcse

新虫 (小有名气)


shengxiang(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
16楼: Originally posted by 老虎大王 at 2010-11-02 10:33:49
你这个问题就问到点子上了。

你是否研究过RDF的计算公式?里边的体积是一个定值,但是NPT系综下的V不是定值,全部的问题就在这里。问题不在于NPT系综下的原子位置可否用来计算RDF,而是在于你如何修正这个 ...

你好,请问一下,如果我计算MSD的话可以使用NVE系综吗?在固体当中的,为看文献上面多采用的是NVT系综不知道是为什么希望您能给我解答
30楼2016-01-13 20:53:35
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