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shengxiang

木虫 (著名写手)

[交流] 【讨论】系综问题

系综的定义大家或多或少的都有所了解,但是在进行动力学模拟时怎么选择系综呢?看很多文献中都是先跑NPT,然后再跑NVT(或者NVE),这样跑的目的应该是先用NPT跑出一个合适的密度(也就是盒子尺寸)。但是,可不可以用NPT系综一下跑到底呢?这对于数据的分析有什么影响?欢迎大家一起来讨论,金币可追加!

[ Last edited by ghcacj on 2010-11-1 at 10:47 ]
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老虎大王

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
shengxiang(金币+1):谢谢参与
ghcacj(金币+7):谢谢 2010-11-01 09:31:33
shengxiang(金币+10): 2010-11-01 23:29:22
系综不同的话,有些热力学性质的统计方法是不一样的。实际上书上给出的多数统计公式,都是对NVE系综而言的,也有NVT的,在NPT下直接统计的情况不多。比如著名的书《The Art of Molecular Dynamics Simulation》,在第四章第二节就专门讲到,他这里讲的统计公式,是在总能量守衡条件下,也就是NVE系综中使用的公式。

也许一些简单的热力学函数,直接平均的那些,是无所谓的,但是若有需要稍加计算的,或者要用到方差之类数据的,比如比热这些,那就会有区别。也许从数值上看问题不大,但原理上还是有讲究的。很多初学者不注意这一点。
11楼2010-10-31 12:38:05
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tianlangxingaa

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
shengxiang(金币+1):谢谢参与
zh1987hs(金币+3):谢谢 2010-10-31 09:11:01
可以在npt下一直跑,在计算性质相同的情况下,NPT系综需要的时间要比NVT长。

所以为了节省时间,大家都是先NPT,再是NVT。

cheers
2楼2010-10-31 08:53:10
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dellus

木虫 (职业作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
shengxiang(金币+1):谢谢参与
zh1987hs(金币+6):谢谢 2010-10-31 11:29:51
shengxiang(金币+10): 2010-11-01 23:31:51
当然可以采用一种系综进行模拟
各种系综之间原则上是等价的,例如,在一个简单体系,采用NVT计算出P0,再把这个P0放入NPT进行计算V,NVT中采用的V0应该在NPT得到V的error bar之内。这个是一个重要的检查程序对错的方法。

在模拟中选取哪一种系综要看你要研究的问题是什么
譬如说,如果研究的是分相问题,最好采用NPT,因为体系在NVT中会形成相界面,会造成两相的计算很不准;
相反,如果研究相界面之间的tenssion,NVT反而更合适;
再者,研究吸附问题,muVT是比较合适的系综。

像你说的先用NPT再用NVT很可能是这种情况,在做硬球模型时,直接把球放到比较小的盒子里很不方便(因为球和球不能接触),所以先把球放入一个很大的盒子,然后在大的压强下产生一个适合小盒子的initial configuration。
另外,产生一个适合密度的说法不太准确,因为你不一定知道NPT采用的压强是否适合。

[ Last edited by dellus on 2010-10-31 at 09:28 ]
岂能尽如人意,但求无愧于心。
4楼2010-10-31 09:27:27
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ouhua

金虫 (著名写手)


shengxiang(金币+1):谢谢参与
不得一个专业,不明白
5楼2010-10-31 09:28:52
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