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heyo_123

至尊木虫 (职业作家)

[交流] 【求助】审稿人意见,不是很懂,大家帮帮忙!


1.“I suggest that the authors include the clarifications for the basis set superposition error(BSSE) calculations in the manuscript.”  这句怎么理解??

2.分子内的BSSE,怎么做,看了几篇文献,还是不会,望高手们指点。


[ Last edited by heyo_123 on 2010-10-27 at 15:05 ]
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


heyo_123(金币+5):谢谢!! 2010-10-28 09:28:11
切割时之所以涉及到分子内相互作用区域构型保持不动,是为了之后做切割后的片段间BSSE校正时尽可能完整还原这个区域产生的E_BSSE。之所以把其它不相干区域挪得相互远离,是由于如果位置保持不变,即紧挨着,在做切割后的片段间BSSE校正时,E_BSSE将会掺进它们的成分。原理上应当在冻住分子内相互作用区域构型不变下优化一下挪动过的无关区域,不过这样做对所得E_BSSE未必能产生明显影响。
涉及到分子内范德华作用时,由于其作用强度很弱,E_BSSE甚至能达到与之相同的数量级,所以此时不能忽略分子内BSSE。由于氢键强度并不很弱,而且使用弥散基组后BSSE的影响会降低很多,E_BSSE与氢键键能相比一般都很小,所以在使用较大的含弥散函数的基组时处理分子内氢键问题没必要考虑麻烦的分子内BSSE校正。
19楼2010-10-27 19:47:16
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Joannaouc

木虫 (著名写手)

heyo_123(金币+1):谢了! 2010-10-26 14:27:21
是不是软件里面有相关的选项啊?
2楼2010-10-26 14:26:14
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


heyo_123(金币+5):能给几个例子吗??我看了好多,就是不知道该怎么做! 2010-10-26 14:48:31
分子内BSSE需要把分子在适当位置进行切割成为2个分子片段后再进行常规BSSE校正处理。注意要让涉及到分子内BSSE的区域仍然保持原来的相对位置不动,而通过调整构型让两个片段中的与BSSE不相关的区域尽量远离。切割点需要进行饱和处理(比如加氢)。
3楼2010-10-26 14:42:52
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)

heyo_123(金币+5):谢谢!!能给几个例子吗》??? 2010-10-26 14:49:12
楼主去查下Sławomir J. Grabowski这个人的文章,他做了好多分子内氢键的BSSE计算。
Anewday,anewhour,anewminute,anewpeople.
5楼2010-10-26 14:45:42
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