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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】有人用Dmol3做过第一性原理分子动力学吗
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chimegreen

木虫 (正式写手)

Dr.

[交流] 【求助】有人用Dmol3做过第一性原理分子动力学吗 已有2人参与

想用dmol跑一些纳米管和graphene第一性原理分子动力学的工作
加点温度
不知道有没有知道设置的时候需要注意些什么
Time step，total simulation time，和thermostat
设置什么值比较主流呢，帮助文件里也说的不清楚，本人对分子动力学也不太了解
请对第一性原理分子动力学有自己理解的朋友帮一下忙吧
谢谢
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快乐科研，快乐生活。
1楼 2010-10-21 15:52:10
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cg陈

铁杆木虫 (著名写手)
我也想知道一些  希望高手解答下哈
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2楼2010-10-21 15:58:45
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chimegreen

木虫 (正式写手)

Dr.
看来很少有人用哦，有用vasp做的吗，介绍一下
道理是一样的
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快乐科研，快乐生活。
3楼2010-10-22 09:12:41
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爱惜花草

木虫 (著名写手)
★
gzqdyouxia(金币+1): 谢谢提示，鼓励交流 2011-02-10 22:11:52
chimegreen(金币+5): 2011-04-26 08:45:58
呵呵 ， 我用啊。
1 fs，5 ps
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一步一步去实现自己的目标，不要让自己成为自己的绊脚石，克制自己！
4楼2011-02-10 19:23:41
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lfzlpd

铜虫 (小有名气)
★
gzqdyouxia(金币+1): 鼓励交流 2011-02-16 15:55:23
chimegreen(金币+5): 2011-04-26 08:45:50
引用回帖:
Originally posted by chimegreen at 2010-10-21 15:52:10:
想用dmol跑一些纳米管和graphene第一性原理分子动力学的工作
加点温度
不知道有没有知道设置的时候需要注意些什么
Time step，total simulation time，和thermostat
设置什么值比较主流呢，帮助文件里也说的不 ...

Doml3里不是默认有：1fs, 1ps, 1000步，300k吗？
我也想试试，但是我的结构建的不好，正在修改参数，继续进行自杀性实验！
哎，愁人，也没个明白人？
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5楼2011-02-16 11:33:26
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zhaoyanfei

木虫 (小有名气)
★
zzy870720z(金币+1): 谢谢指教 2011-03-22 08:14:34
Doml3不能吧，第一性原理分子动力学需要解含时的薛定谔方程，Doml3好像还只能解不含时的……
赞一下(1人) 回复此楼
以虚养心，以德养身，以仁义养天下万物，以道养天下万世
6楼2011-03-21 21:13:07
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zhaoyanfei

木虫 (小有名气)
zzy870720z: 重复作答了，呵呵，还是表示感谢 2011-03-22 08:14:57
Doml3不能吧，第一性原理分子动力学需要解含时的薛定谔方程，Doml3好像还只能解不含时的……
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以虚养心，以德养身，以仁义养天下万物，以道养天下万世
7楼2011-03-21 21:14:09
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chimegreen

木虫 (正式写手)

Dr.
引用回帖:
Originally posted by zhaoyanfei at 2011-03-21 21:14:09:
Doml3不能吧，第一性原理分子动力学需要解含时的薛定谔方程，Doml3好像还只能解不含时的……

可以
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快乐科研，快乐生活。
8楼2011-03-22 09:07:16
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dingniu2

木虫 (正式写手)
同问 望高手解答
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健康最重要
9楼2011-09-06 13:25:41
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
zzy870720z(金币+1): 谢谢提示 2011-09-08 09:11:43
引用回帖:
6楼: Originally posted by zhaoyanfei at 2011-03-21 21:13:07:
Doml3不能吧，第一性原理分子动力学需要解含时的薛定谔方程，Doml3好像还只能解不含时的……

拜托，6楼你的意思是不是TD-DFT啊？
MS5.5的DMol3里已经有了经验性的TD-DFT修正了
Google学术里搜索molecular dynamics + DMol3能出来一堆呢
赞一下(2人) 回复此楼
10楼2011-09-07 09:58:20
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