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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【求助】MS中分子动力学计算
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月只蓝

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10楼: Originally posted by Happy丘丘 at 2014-04-15 19:10:58
我现在想做个动力学模拟  氢气在MOF材料里的扩散性能的数值模拟   能请教一下怎么做么   现在我是构建了MOF材料  后面就不会了...

MS--> Help-->Tutorials--> Discover Tutorials-->Measuring the diffusivity of a gas in a polymer
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11楼2014-04-15 19:16:31
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Happy丘丘

铜虫 (小有名气)
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11楼: Originally posted by 月只蓝 at 2014-04-15 19:16:31
MS--> Help-->Tutorials--> Discover Tutorials-->Measuring the diffusivity of a gas in a polymer...

还是不懂啊

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12楼2014-04-15 19:54:47
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月只蓝

主管区长 (职业作家)
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12楼: Originally posted by Happy丘丘 at 2014-04-15 19:54:47
还是不懂啊
...

这是MS软件中自带的具体例子，是讲气体在聚合物中扩散，求扩散系数的例子，感觉和你要做的比较类似。
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13楼2014-04-15 20:55:18
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Happy丘丘

铜虫 (小有名气)
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13楼: Originally posted by 月只蓝 at 2014-04-15 20:55:18
这是MS软件中自带的具体例子，是讲气体在聚合物中扩散，求扩散系数的例子，感觉和你要做的比较类似。...

额，大神，你会不会做，能不能知道我一下

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14楼2014-04-15 21:01:13
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月只蓝

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14楼: Originally posted by Happy丘丘 at 2014-04-15 21:01:13
额，大神，你会不会做，能不能知道我一下
...

跟着例子做，上手很快。
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15楼2014-04-15 21:02:19
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lanchunlan

新虫 (初入文坛)
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问一下，若是想做一个带正电荷的有机溶剂，并且几何优化，应该怎么办啊？例如，N上少了一个H，显+1价，计算的时候应该怎么弄啊？
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16楼2014-04-15 22:09:00
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Happy丘丘

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15楼: Originally posted by 月只蓝 at 2014-04-15 21:02:19
跟着例子做，上手很快。...

跟着例子做，总是失败。。。。

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17楼2014-04-16 13:56:18
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16楼: Originally posted by lanchunlan at 2014-04-15 22:09:00
问一下，若是想做一个带正电荷的有机溶剂，并且几何优化，应该怎么办啊？例如，N上少了一个H，显+1价，计算的时候应该怎么弄啊？

如果是做MD，并且有力场涵盖该基团，力场会自动分配电荷
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18楼2014-04-16 14:26:40
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Happy丘丘

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15楼: Originally posted by 月只蓝 at 2014-04-15 21:02:19
跟着例子做，上手很快。...

No charge groups have been calculated.
One or more of the particles that are being considered for a charge group are already part of a charge group.
Please remove the charge group(s) and try again.我按照你给的那个例子做的时候出现的问题
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19楼2014-04-18 11:17:04
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月只蓝

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19楼: Originally posted by Happy丘丘 at 2014-04-18 11:17:04
No charge groups have been calculated.
One or more of the particles that are being considered for a charge group are already part of a charge group.
Please remove the charge group(s) and try again ...

这是MS软件中自带的官方教程，我以前做过没有问题；如果出现问题，大多是你的操作没有按教程来。
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20楼2014-04-18 11:28:06
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