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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Monte Carlo » 【求助】nvt中速度一直增大
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老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+5, 模拟EPI+1):谢谢，精彩回答。 2010-10-20 15:02:59
你写程序是自己用还是只是为了学习？
如果是自己使用，我以前也说过，不鼓励初学者自己编程。MD程序如果不是很通用的那种，则一般来说不能算是很大型的程序，但是即使写一个并非很大型的完整的MD程序，实际上的任务量也相当可观，需要较多的技巧，以及对MD原理比较深入的理解。一时间是不容易完成的。而且对于分子模拟工作者来说，重要的是模拟思想，是相关的物理学、化学知识，而不是编程技巧，在编程上费力，我个人认为划不着。而且现在成熟通用的MD程序很多，大多数是免费的。如果有那个精力的话，建议初学者放在MD结果辅助分析程序的编写上。
初学者为了掌握MD的思想和基本方法、基本步骤，学编一些MD小程序也是可以的。这方面是有一些教程的，也有一些小型的参考程序，比如《分子模拟——从算法到应用》一书，比如《液体的计算机模拟》一书的附录程序等，其它也有不少。如果能读懂这些示例程序，对MD模拟的认识会加深许多。
当然，以上主要是对研究生而言，毕竟研究生的工作是有时间限制的。如果你是老师或者科研人员，在已经具备相当的基础的情况下，又有时间和精力，要编一些MD程序，供自己和别人使用，那倒是应该提倡的，毕竟我们有自主知识产权的计算软件还相当少。

[ Last edited by 老虎大王 on 2010-10-20 at 08:11 ]
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4楼2010-10-20 08:04:34
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