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Ran2010

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】关于酵母蛋白激酶网络测绘的一些问题

看了今年science上的酵母中蛋白激酶和磷酸化酶网络测绘的文章
刚刚接触这方面的东西,有很多不明白的,希望大家帮帮忙哈~

1.首先他用这样一个流程来测绘:
抗原决定表位标记,磁子捕获,胰蛋白酶分解,质谱测定,hit scoring matrix,显著性分析,网络构建
两个蛋白之间的反应是怎么被确定的?hit scoring matrix是什么,其横坐标为baits,纵坐标为hits,分别代表什么含义?

2.TOR(target of rapamycin)含量的上升会导致更高的rapamycin抵抗力么?如果TOR complex的某些成分和其他激酶或磷酸化酶反应,会导致抵抗力变化么?

3.NNK1(N网络激酶)与TOR complex1的成分蛋白和Gdh2(glu 分解酶,分解产物是氨和酮戊二酸)相互作用。NNK1的过量表达会导致对rapamycin敏感。
现象是在glu作为唯一氮源的培养基上,gdh缺陷型会表现出rapamycin抵抗力
能帮解释一下原因么?是因为glu作为氮源时,Gdh2的表达量会升高,从而诱导NNK1的表达升高么?

4.最后一个问题,TOR complex1 effector Ure2 通过在细胞质内 sequestering 转录因子Gln3 来调节nitrogen catabolite response, 这句话的英文部分我不太明白,麻烦帮解释下(不是翻译哈)~

问题很多,麻烦大家了,谢谢先~
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林祎

木虫 (正式写手)

楼主 ,文章呢?
2楼2010-11-07 21:51:52
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Ran2010

新虫 (初入文坛)

a globla protein kinase and phosphatase interaction network in yeast
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20489023
3楼2010-11-08 07:15:59
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