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Ran2010

新虫 (初入文坛)

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[交流] 【求助/交流】关于酵母蛋白激酶网络测绘的一些问题

看了今年science上的酵母中蛋白激酶和磷酸化酶网络测绘的文章
刚刚接触这方面的东西，有很多不明白的，希望大家帮帮忙哈~

1.首先他用这样一个流程来测绘：
抗原决定表位标记，磁子捕获，胰蛋白酶分解，质谱测定，hit scoring matrix，显著性分析，网络构建
两个蛋白之间的反应是怎么被确定的？hit scoring matrix是什么，其横坐标为baits，纵坐标为hits，分别代表什么含义？

2.TOR（target of rapamycin）含量的上升会导致更高的rapamycin抵抗力么？如果TOR complex的某些成分和其他激酶或磷酸化酶反应，会导致抵抗力变化么？

3.NNK1（N网络激酶）与TOR complex1的成分蛋白和Gdh2（glu 分解酶，分解产物是氨和酮戊二酸）相互作用。NNK1的过量表达会导致对rapamycin敏感。
现象是在glu作为唯一氮源的培养基上，gdh缺陷型会表现出rapamycin抵抗力
能帮解释一下原因么？是因为glu作为氮源时，Gdh2的表达量会升高，从而诱导NNK1的表达升高么？

4.最后一个问题，TOR complex1 effector Ure2 通过在细胞质内 sequestering 转录因子Gln3 来调节nitrogen catabolite response，这句话的英文部分我不太明白，麻烦帮解释下（不是翻译哈）~

问题很多，麻烦大家了，谢谢先~

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