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【求助/交流】关于酵母蛋白激酶网络测绘的一些问题
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看了今年science上的酵母中蛋白激酶和磷酸化酶网络测绘的文章 刚刚接触这方面的东西，有很多不明白的，希望大家帮帮忙哈~ 1.首先他用这样一个流程来测绘： 抗原决定表位标记，磁子捕获，胰蛋白酶分解，质谱测定，hit scoring matrix，显著性分析，网络构建 两个蛋白之间的反应是怎么被确定的？hit scoring matrix是什么，其横坐标为baits，纵坐标为hits，分别代表什么含义？ 2.TOR（target of rapamycin）含量的上升会导致更高的rapamycin抵抗力么？如果TOR complex的某些成分和其他激酶或磷酸化酶反应，会导致抵抗力变化么？ 3.NNK1（N网络激酶）与TOR complex1的成分蛋白和Gdh2（glu 分解酶，分解产物是氨和酮戊二酸）相互作用。NNK1的过量表达会导致对rapamycin敏感。 现象是在glu作为唯一氮源的培养基上，gdh缺陷型会表现出rapamycin抵抗力 能帮解释一下原因么？是因为glu作为氮源时，Gdh2的表达量会升高，从而诱导NNK1的表达升高么？ 4.最后一个问题，TOR complex1 effector Ure2 通过在细胞质内 sequestering 转录因子Gln3 来调节nitrogen catabolite response， 这句话的英文部分我不太明白，麻烦帮解释下（不是翻译哈）~ 问题很多，麻烦大家了，谢谢先~ |
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林祎
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a globla protein kinase and phosphatase interaction network in yeast http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20489023 |
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