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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】知道这些数据之后如何在MS中建模？
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cuimingshan

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】知道这些数据之后如何在MS中建模？ 已有3人参与

*data for   ICSD #66559
Coll Code   66559
Rec  Date   1994/01/19
Chem Name   Aluminium Oxide (2.1/3.2) - Gamma
Structured  Al2.144 O3.2
Sum         Al2.144 O3.2
ANX         A21X32
D(calc)     3.66
Title       Structures and transformation mechanisms of the eta, gamma and theta
            transition aluminas
Author(s)   Zhou, R.-S.;Snyder, R.L.
Reference   Acta Crystallographica B (39,1983-)
            (1991), 47, 617-630
Unit Cell   7.911(2) 7.911(2) 7.911(2) 90. 90. 90.
Vol         495.1
Z           10
Space Group F d -3 m Z
SG Number   227
Cryst Sys   cubic
Pearson     cF53
Wyckoff     e2 d a
R Value     .076
Red Cell    F  5.593 5.593 5.593 60 60 60 123.775
Trans Red   0.500 0.500 0.000 / 0.000 0.500 0.500 / 0.500 0.000 0.500
Comments    Total SOF on at least one site differs from unity (SOF  1.003)
            Neutron diffraction (powder)
            Rietveld profile refinement applied
            Deviation of the charge sum from zero tolerable.
Atom  #   OX   SITE      x           y           z           SOF      H        ITF(B)   
O    1  -2    32 e  0.2547(5)   0.2547(5)   0.2547(5)      1.         0              1.
Al   1  +3    16 d  0.5         0.5         0.5            0.58(1)    0             0.5
Al   2  +3    8 a   0.125       0.125       0.125          0.84(2)    0             0.5
Al   3  +3    32 e  0.0272(24)  0.0272(24)  0.0272(24)     0.17(2)    0             0.5
*end for    ICSD #6655
我是这样做的  build/crystals/build crystal  对话框中space group下的enter group选择F d -3 m  ，在add atoms后模型完全不是文献中的样子，请问如何解决？
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1楼 2010-10-14 18:10:03
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qli0218

木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流

*data for   ICSD #95302
Coll Code   95302
Rec  Date   2003/10/01
Chem Name   Aluminium Oxide (2.67/4) - Gamma
Structured  (Al2 O3)1.333
Sum         Al2.666 O3.999
ANX         A21X32
Min Name    Alumina
D(calc)     3.68
Title       Theoretical structure determination of gamma-(Al2 O3)
Author(s)   Gutierrez, G.;Taga, A.;Johansson, B.
Reference   Physical Review, Serie 3. B - Condensed Matter (18,1978-)
            (2001), 65, 0121011-0121014
Unit Cell   7.887 7.887 7.887 90 90 90
Vol         490.61
Z           8
Space Group F d -3 m Z
SG Number   227
Cryst Sys   cubic
Pearson     cF53
Wyckoff     e d a
Red Cell    F  5.576 5.576 5.576 60 60 60 122.652
Trans Red   0.500 0.500 0.000 / 0.000 0.500 0.500 / 0.500 0.000 0.500
Comments    Total SOF on at least one site differs from unity (SOF  1.003)
            Compound with mineral name: Alumina
            Modulated structure
            Structure calculated theoretically
            Structure type : defect-spinel
            No R value given in the paper.
            At least one temperature factor missing in the paper.
Atom  #   OX   SITE      x           y           z           SOF      H
Al   1  +3    8 a   0.125       0.125       0.125          1.         0   
Al   2  +3    16 d  0.5         0.5         0.5            0.8333     0   
O    1  -2    32 e  0.255       0.255       0.255          1.         0   
*end for    ICSD #95302

这个是什么？和上面的ICSD #99836有什么不一样啊，我还找到了一个：

*data for   ICSD #30267
Coll Code   30267
Rec  Date   1980/01/01
Chem Name   Aluminium Oxide - Gamma
Structured  (Al2 O3)1.333
Sum         Al2.666 O3.999
ANX         A3X4
D(calc)     3.66
Title       The Structure of the electrolytical Oxide Layer on Aluminium
Author(s)   Verwey, E.J.W.
Reference   Zeitschrift fuer Kristallographie, Kristallgeometrie, Kristallphysik, Kristallchemie (-144,1977)
            (1935), 91, 317-320
Unit Cell   3.95 3.95 3.95 90. 90. 90.
Vol         61.63
Z           1
Space Group F m -3 m
SG Number   225
Cryst Sys   cubic
Pearson     cF7
Wyckoff     c b a
Red Cell    F  2.793 2.793 2.793 60 60 60 15.407
Trans Red   0.500 0.500 0.000 / 0.000 0.500 0.500 / 0.500 0.000 0.500
Comments    Total SOF on at least one site differs from unity (SOF  1.003)
            No R value given in the paper.
            At least one temperature factor missing in the paper.
Atom  #   OX   SITE      x           y           z           SOF      H
O    1  -2    4 a   0           0           0              1.         0   
Al   1  +3    4 b   0.5         0.5         0.5            0.4665     0   
Al   2  +3    8 c   0.25        0.25        0.25           0.0999     0   
*end for    ICSD #30267

究竟用哪个对啊，做Al2O3表面吸附反应用哪个建模啊？

请教高人
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12楼2011-02-20 13:41:35
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cash_ms

木虫 (正式写手)
cuimingshan(金币+1): 2010-10-15 08:13:59
引用回帖:
Originally posted by cuimingshan at 2010-10-14 18:10:03:
*data for   ICSD #66559
Coll Code   66559
Rec  Date   1994/01/19
Chem Name   Aluminium Oxide (2.1/3.2) - Gamma
Structured  Al2.144 O3.2
Sum         Al2.144 O3.2
ANX         A21X32
D(calc)    ...

你的建模方法没有问题
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2楼2010-10-14 18:52:31
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fzx2008

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主
★
zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2010-10-14 19:49:17
cuimingshan(金币+1): 2010-10-15 08:14:09
Al格位出现分数占据
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3楼2010-10-14 19:00:48
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cuimingshan

金虫 (小有名气)

求助

引用回帖:
Originally posted by cuimingshan at 2010-10-14 18:10:03:
*data for   ICSD #66559
Coll Code   66559
Rec  Date   1994/01/19
Chem Name   Aluminium Oxide (2.1/3.2) - Gamma
Structured  Al2.144 O3.2
Sum         Al2.144 O3.2
ANX         A21X32
D(calc)    ...

但是我建模怎么就不成功呢？关键是lattice parameters里面的限制,我没办法设置angels和lengths 怎么办？
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不逼自己一把不知道自己多么优秀！
4楼2010-10-14 20:44:38
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