| 查看: 473 | 回复: 3 | |||
[交流]
【求助】高分子模拟中链上小珠的距离问题已有2人参与
|
|
各位大侠好，我是一名fortran编程的新手，我要做一个高分子在通道中运动的一个MD的模拟，但是相邻小珠之间的距离我要不要考虑进去呢？在运行的时候总是有相邻的珠子之间的距离很远，以至于我觉得它已经不是一条链了，小珠会到处乱飞，请问这是正常的么？如果不正常我该如何实现这一部分的编程呢？请高手指教！ 谢谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
职称评审没过，求安慰
已经有22人回复
-
申请26博士
已经有4人回复
-
垃圾破二本职称评审标准
已经有15人回复
-
投稿Elsevier的Neoplasia杂志，到最后选publishing options时页面空白，不能完成投稿
已经有20人回复
-
EST投稿状态问题
已经有7人回复
-
毕业后当辅导员了，天天各种学生超烦
已经有4人回复
-
聘U V热熔胶研究人员
已经有10人回复
-
求助文献
已经有3人回复
-
投稿返修后收到这样的回复，还有希望吗
已经有8人回复
-
三无产品还有机会吗
已经有6人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
yahoohoo
铁杆木虫 (著名写手)
- 模拟EPI: 10
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 1.55
- 金币: 7632.4
- 散金: 251
- 红花: 4
- 帖子: 1176
- 在线: 167小时
- 虫号: 74894
- 注册: 2005-06-15
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+4):谢谢 2010-10-23 08:49:16
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+4):谢谢 2010-10-23 08:49:16
|
相邻 BEADS之间的距离由相互作用所控制。比如你采用Harmonic Potential $U_b = 1/2 k_b (r - r_0)^2$，那么相邻 BEADS 之间的距离平均值应该在$r_0$。 “乱飞”是什么概念，：）。请用专业化的语言来描述。你在模拟中是否采用了周期性边界条件以及最小镜像法则( Minimum Image Convention)？ 可能的话，建议你使用c++。fortran的语法太死板，编写好的程序管理以及修改不如c++方便。 |
2楼2010-10-22 22:23:02
3楼2010-10-22 23:53:45
yahoohoo
铁杆木虫 (著名写手)
- 模拟EPI: 10
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 1.55
- 金币: 7632.4
- 散金: 251
- 红花: 4
- 帖子: 1176
- 在线: 167小时
- 虫号: 74894
- 注册: 2005-06-15
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
4楼2010-10-23 03:31:14