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【求助】高分子模拟中链上小珠的距离问题已有2人参与
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各位大侠好，我是一名fortran编程的新手，我要做一个高分子在通道中运动的一个MD的模拟，但是相邻小珠之间的距离我要不要考虑进去呢？在运行的时候总是有相邻的珠子之间的距离很远，以至于我觉得它已经不是一条链了，小珠会到处乱飞，请问这是正常的么？如果不正常我该如何实现这一部分的编程呢？请高手指教！ 谢谢！ |
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yahoohoo
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+4):谢谢 2010-10-23 08:49:16
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zh1987hs(金币+4):谢谢 2010-10-23 08:49:16
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相邻 BEADS之间的距离由相互作用所控制。比如你采用Harmonic Potential $U_b = 1/2 k_b (r - r_0)^2$，那么相邻 BEADS 之间的距离平均值应该在$r_0$。 “乱飞”是什么概念，：）。请用专业化的语言来描述。你在模拟中是否采用了周期性边界条件以及最小镜像法则( Minimum Image Convention)？ 可能的话，建议你使用c++。fortran的语法太死板，编写好的程序管理以及修改不如c++方便。 |
2楼2010-10-22 22:23:02
3楼2010-10-22 23:53:45
yahoohoo
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4楼2010-10-23 03:31:14