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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 【讨论】lammps里的boundary的位置能够随意更改？
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xiaowu787

木虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】lammps里的boundary的位置能够随意更改？ 已有5人参与

现在的模型分成了几个部分，其中一个部分需要按一定的初始速度的运动，直到与令一部分接触，这时候才对体系增加三维周期边界条件。这里的周期性条件如何实现呢？以及box的问题，真正的box的大小就是在增加三维周期性边界条件时候的模型大小。不知大家有没有这方面的经验？
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1楼 2010-10-09 16:24:56
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xiaowu787

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 老虎大王 at 2010-10-12 17:19:54:
按我的想法，你只有一个BOX，中间部分是空的，然后两边原子以一定速度相向而行。这种模拟应该在NVE下进行，在撞击的方向应该是非周期边界条件，因为高速碰撞过程通常是绝热的，也来不及膨胀，建议你先不要考虑体积 ...

谢谢您的建议！
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12楼2010-10-12 21:49:29
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老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+3):谢谢 2010-10-09 17:57:18
这个你要试一下，很可能在一个输入文件里是不能改变边界性质的吧，我也不清楚，你设计一个小的script试一下就知道了。如果不行的话，你也许可以用jump来转到另一个文件，或者从新运行。问题可能在于你运行到什么时候进行切换。
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2楼2010-10-09 17:19:07
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xiaowu787

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
zh1987hs(金币+3):谢谢 2010-10-10 19:55:25
引用回帖:
Originally posted by 老虎大王 at 2010-10-09 17:19:07:
这个你要试一下，很可能在一个输入文件里是不能改变边界性质的吧，我也不清楚，你设计一个小的script试一下就知道了。如果不行的话，你也许可以用jump来转到另一个文件，或者从新运行。问题可能在于你运行到什么时 ...

就是边界性质的问题不好处理，lammps好像是不能改变边界性质。如果用jump的话，那么体系原来的性质就会不复存在了，现在还需要原始体系的一些性质。原来想着在不加周期边界条件时先碰撞一下待接触时再添加周期边界条件，这样时间点不易选取。
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3楼2010-10-10 19:35:43
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bluewhale

铁杆木虫 (正式写手)
★
zh1987hs(金币+1):谢谢 2010-10-10 22:25:49
在不改变边界条件的情况下是否也能完成同样的事情，或许问题的提法可以变通一下。
由于不知道你具体情况，不好说。
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4楼2010-10-10 21:43:53
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