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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】最小化方法的选择
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zhulijuan001

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】最小化方法的选择

看了很多文献，有的最小化是先用共轭梯度法再用最陡下降法，也有只用最陡下降法的，想问问如果只用最陡下降法进行最小化是否会对最小化的结果有什么不好影响？还是只用达到最小化，用什么方法都行？初学者，谢谢啦！
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1楼 2010-10-07 15:34:05
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qasd

木虫 (著名写手)
★ ★
zhulijuan001(金币+1):谢谢参与
zh1987hs(金币+1):谢谢 2010-10-07 21:28:55
zhulijuan001(金币+1): 2010-10-08 16:50:41
都行，这个只与最小化花费的时间有关，与结果无关
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2楼2010-10-07 19:14:59
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zhulijuan001

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by qasd at 2010-10-07 19:14:59:
都行，这个只与最小化花费的时间有关，与结果无关

谢谢，还有个问题想不通，就是最小化以后对体系进行MD模拟，有先固定蛋白质对溶剂分子进行模拟，不知道判断模拟达到平衡的标准时什么呢？
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3楼2010-10-07 19:51:53
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chzhbin

金虫 (职业作家)
★ ★
zhulijuan001(金币+1):谢谢参与
zh1987hs(金币+1):谢谢 2010-10-08 07:46:42
有没有看过创腾公司的视频  呵呵 讲的很好的 呵呵
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4楼2010-10-07 21:54:13
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zhulijuan001

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by chzhbin at 2010-10-07 21:54:13:
有没有看过创腾公司的视频  呵呵 讲的很好的 呵呵

没有看过，网址是什么呀？
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5楼2010-10-08 08:42:20
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