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ronnie5031

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】大家能帮我分析下计算静电势得到的cube文件数据吗?

大家好,我想得到分子内每个原子静电势数据,看了些论坛上的做法,优化了结构的fchk文件生成了cube文件,看了里面的数据,不知道代表什么意思,请高手赐教!下面是cube文件中的开头部分(剩下的基本和这部分下边的六个数一行的坐标一样.)
Title Card Required potential
Electrostatic potential from Total SCF Density
   15  -23.991854  -11.827581  -11.406689
  152    0.291411    0.000000    0.000000
   83    0.000000    0.291411    0.000000
   79    0.000000    0.000000    0.291411
    6    6.000000    4.646810   -1.135248    0.008095
    6    6.000000    3.044006    1.262509   -0.011193
   53    7.000000   -1.031207    0.657013    0.005368
   53    7.000000    8.690943   -0.430264   -0.009373
    9    9.000000    3.771267    2.665842    2.057815
    9    9.000000    3.760292    2.624989   -2.111129
    9    9.000000    4.082817   -2.519275    2.099414
    9    9.000000    4.071969   -2.559981   -2.052685
   35    7.000000   -7.044016    0.030454    0.026741
    1    1.000000  -12.807703   -0.391259    1.913441
    6    6.000000  -13.522471   -0.524814   -0.014780
    1    1.000000  -12.921058    1.162133   -1.034189
    1    1.000000  -12.638324   -2.157310   -0.909197
    6    6.000000  -16.280855   -0.760456   -0.032750
    7    7.000000  -18.508625   -0.950462   -0.047242
-4.33912E-02 -4.37207E-02 -4.40510E-02 -4.43820E-02 -4.47133E-02 -4.50448E-02
-4.53761E-02 -4.57069E-02 -4.60369E-02 -4.63657E-02 -4.66930E-02 -4.70182E-02
-4.73409E-02 -4.76607E-02 -4.79770E-02 -4.82893E-02 -4.85970E-02 -4.88995E-02
-4.91960E-02 -4.94861E-02 -4.97688E-02 -5.00436E-02 -5.03097E-02 -5.05663E-02
-5.08126E-02 -5.10479E-02 -5.12713E-02 -5.14821E-02 -5.16796E-02 -5.18629E-02
-5.20313E-02 -5.21842E-02 -5.23210E-02 -5.24410E-02 -5.25437E-02 -5.26286E-02
-5.26955E-02 -5.27438E-02 -5.27736E-02 -5.27845E-02 -5.27765E-02 -5.27498E-02
-5.27043E-02 -5.26404E-02 -5.25583E-02 -5.24584E-02 -5.23411E-02 -5.22070E-02
-5.20567E-02 -5.18907E-02 -5.17098E-02 -5.15146E-02 -5.13060E-02 -5.10846E-02
-5.08513E-02 -5.06068E-02 -5.03519E-02 -5.00875E-02 -4.98142E-02 -4.95328E-02
-4.92441E-02 -4.89487E-02 -4.86474E-02 -4.83408E-02 -4.80294E-02 -4.77139E-02
-4.73949E-02 -4.70729E-02 -4.67483E-02 -4.64217E-02 -4.60934E-02 -4.57639E-02
-4.54335E-02 -4.51026E-02 -4.47714E-02 -4.44404E-02 -4.41097E-02 -4.37796E-02
-4.34504E-02
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


★ ★
zhou2009(金币+2): 2010-09-30 07:57:57
2楼2010-09-29 18:59:31
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我是丫头

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
你要的不是这些数据啊,你从Gaussian 03W里选择utilities里面的CubeGen ,然后进行操作,在Gaussian View里选cub文件,然后做静电势分析!我QQ644917656,大家一起讨论吧,我现在正在做静电势这部分!
3楼2011-06-03 20:49:17
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