应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】BSSE计算出错
52/1返回列表
查看: 2135  |  回复: 16
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

saradzj

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】BSSE计算出错已有3人参与

计算BSSE时出错，出错提示：
Atoms in 1 layers/fragments were specified but there should be 2.
Error termination via Lnk1e in C:\G03W\l101.exe at Wed Sep 29 11:13:29 2010.

输入文件如下：
%Chk=SB3LYP.chk
%mem=200mb
%rwf=d:\1,1gb,d:\2,1gb,d:\3,1gb,d:\4,1gb,d:\5,1gb,d:\6,1gb,d:\7,1gb
#p RB3LYP/6-31G counterpoise=2

s bsse

0   1
C 0    0.801295   -0.010523    0.864356
C 0    0.801295    1.379536    0.864356
C 0    2.007906    2.070257    0.864356
C 0    3.211718    1.377625    0.897499
C 0    3.213002   -0.017532    0.908515
C 0    2.002512   -0.710466    0.874214
C 0    4.513105   -0.789634    0.936440
C 0    5.234451   -0.540830   -0.398798
O 0    4.780318   -1.344917   -1.395978
C 0    5.206665   -1.101471   -2.717722
O 0    5.323166   -0.471087    2.036059
O 0    6.105927    0.277509   -0.622883
H 0   -0.158089   -0.560665    0.851911
H 0   -0.149587    1.936012    0.852722
H 0    2.017018    3.174679    0.806696
H 0    4.156362    1.936033    0.887186
H 0    1.991967   -1.814567    0.842040
H 0    4.329822   -1.885895    1.104905
H 0    4.678847   -1.890174   -3.274366
H 0    6.290264   -1.206638   -2.832189
H 0    4.886543   -0.107303   -3.073539
H 0    5.580237    0.440982    1.961021
C 0    2.337127   -0.328367   -5.916906
C 0    3.628295    0.540942   -6.020948
C 0    3.699363    1.615245   -4.896874
C 0    2.344710    2.385934   -4.785525
C 0    1.169448    1.376043   -4.707191
C 0   -0.251931    1.980223   -4.722135
O 0    4.734053   -0.352635   -5.931157
O 0    4.665395    2.606851   -5.259844
O 0    2.310963    3.117058   -3.553680
O 0    1.194205    0.477298   -5.817493
O 0   -0.759331    2.358950   -5.982447
C 0    1.089396   -4.744028   -3.193044
C 0    2.265240   -4.840197   -4.205634
C 0    2.838192   -3.456205   -4.593907
C 0    1.710331   -2.417201   -4.877466
C 0    0.572724   -2.475442   -3.818339
C 0   -0.725584   -1.716398   -4.195470
O 0    3.332105   -5.599530   -3.637199
O 0    3.536606   -3.595478   -5.838669
O 0    2.334236   -1.131233   -4.758451
O 0    0.122891   -3.809028   -3.570508
O 0   -1.478041   -2.297275   -5.238757
C 0    0.395700   -5.160782    1.946548
C 0    1.919927   -5.243790    1.646393
C 0    2.233537   -4.586032    0.284981
C 0    1.354047   -5.228817   -0.830737
C 0   -0.132258   -5.422841   -0.405746
C 0   -0.891102   -6.508554   -1.213278
O 0    2.727225   -4.859965    2.741034
O 0    3.615530   -4.616149   -0.039808
O 0    1.449708   -4.292562   -1.906996
O 0   -0.344383   -5.809572    0.950938
O 0   -0.529567   -7.843440   -0.927751
C 0   -2.781598   -1.472661    4.042615
C 0   -2.272133   -2.711916    4.837590
C 0   -0.963754   -3.238270    4.199101
C 0   -1.271866   -3.590880    2.708150
C 0   -1.956429   -2.398072    1.972466
C 0   -2.612612   -2.875021    0.654095
O 0   -2.307532   -2.562013    6.239939
O 0   -0.593940   -4.457626    4.848156
O 0   -0.046294   -3.816861    2.000764
O 0   -3.034979   -1.814017    2.708922
O 0   -3.216926   -1.833348   -0.083226
C 0   -1.775989    3.672521    4.161781
C 0   -0.710515    2.910076    5.005159
C 0   -0.611803    1.450767    4.501344
C 0   -2.020709    0.783430    4.612655
C 0   -3.150088    1.675218    4.013076
C 0   -4.535730    1.312708    4.613643
O 0   -5.623930    1.593600    3.761718
O 0    0.518762    3.581784    5.170117
O 0    0.295518    0.774574    5.374786
O 0   -1.858310   -0.422321    3.865990
O 0   -3.032272    3.070368    4.300045
C 0   -1.383267    5.799223   -0.646147
C 0   -1.668919    6.683616    0.603467
C 0   -1.227697    5.905382    1.861896
C 0   -2.070315    4.594998    1.933572
C 0   -2.156046    3.841808    0.569420
C 0   -3.438505    2.976997    0.475706
O 0   -1.255308    8.025542    0.473238
O 0   -1.535825    6.670120    3.030985
O 0   -1.414724    3.653451    2.794333
O 0   -2.159259    4.635069   -0.620362
O 0   -4.648808    3.671913    0.682066
C 0    2.686086    4.475335   -3.637148
C 0    3.259818    4.993515   -2.288164
C 0    2.184780    5.112967   -1.180583
C 0    0.836424    5.716923   -1.686908
C 0    0.452798    5.240293   -3.113277
C 0   -0.589058    6.146717   -3.817792
O 0    4.255171    4.086773   -1.814724
O 0    2.754297    6.019939   -0.223905
O 0   -0.093594    5.232218   -0.713353
O 0    1.549649    5.199713   -4.025773
O 0   -0.332473    7.532539   -3.758117
C 0    5.725256   -0.187385   -6.911875
C 0    5.942171    2.440483   -4.699528
C 0   -0.270649    3.566092   -6.508230
C 0    3.318554   -6.962900   -3.970117
C 0    4.926906   -3.750507   -5.730630
C 0   -1.155415   -1.868362   -6.537613
C 0    2.966488   -3.492700    2.957466
C 0    4.192967   -5.885669   -0.221233
C 0    0.528843   -8.369488   -1.684704
C 0   -1.351906   -1.750566    6.870565
C 0    0.547399   -4.373889    5.661099
C 0   -2.336312   -1.045930   -0.843669
C 0   -5.612180    0.890539    2.542807
C 0    1.320001    3.808119    4.039036
C 0    1.213209   -0.077179    4.740451
C 0    0.113227    8.328089    0.535695
C 0   -0.412455    7.088676    3.762393
C 0   -5.188735    4.334373   -0.433654
C 0    5.571366    4.568023   -1.887939
C 0    2.579151    5.663307    1.119722
C 0    0.539700    8.042776   -4.735482
H 0    2.151890   -0.904006   -6.855030
H 0    3.598745    1.056861   -7.014305
H 0    3.960355    1.121405   -3.918140
H 0    2.201833    3.060999   -5.673211
H 0    1.266405    0.804207   -3.747210
H 0   -0.323262    2.808729   -3.984815
H 0   -0.968419    1.176718   -4.443257
H 0    0.508525   -5.702184   -3.185852
H 0    1.865249   -5.337419   -5.126848
H 0    3.517355   -3.069038   -3.782359
H 0    1.278216   -2.575510   -5.904003
H 0    0.948399   -2.030611   -2.862199
H 0   -0.524956   -0.635459   -4.374971
H 0   -1.442817   -1.779681   -3.346637
H 0    0.127510   -5.751023    2.855116
H 0    2.186478   -6.330563    1.614375
H 0    2.077940   -3.473313    0.336306
H 0    1.813536   -6.214569   -1.130165
H 0   -0.671345   -4.448885   -0.562095
H 0   -0.832286   -6.287546   -2.300122
H 0   -1.958626   -6.510858   -0.924835
H 0   -3.782162   -1.142581    4.414855
H 0   -3.061652   -3.502882    4.754152
H 0   -0.147681   -2.464343    4.251706
H 0   -1.935606   -4.490596    2.663663
H 0   -1.194805   -1.599149    1.756281
H 0   -3.471424   -3.543053    0.844738
H 0   -1.867774   -3.424966    0.039762
H 0   -1.962976    4.700634    4.551499
H 0   -1.044470    2.921235    6.072915
H 0   -0.253397    1.424271    3.437282
H 0   -2.243310    0.544229    5.686699
H 0   -3.174308    1.562272    2.889558
H 0   -4.784485    1.924470    5.499872
H 0   -4.570054    0.247117    4.922792
H 0   -1.708045    6.303520   -1.589446
H 0   -2.773787    6.865959    0.642188
H 0   -0.129976    5.664008    1.803568
H 0   -3.098560    4.833728    2.305654
H 0   -1.272912    3.151866    0.470538
H 0   -3.471216    2.239843    1.314424
H 0   -3.452686    2.409893   -0.476726
H 0    3.391642    4.689114   -4.475475
H 0    3.690434    6.007786   -2.494726
H 0    2.004361    4.099374   -0.716893
H 0    0.875975    6.838452   -1.649046
H 0    0.015154    4.205661   -3.055717
H 0   -1.561072    6.084330   -3.288392
H 0   -0.744926    5.798240   -4.864773
H 0    6.322786   -1.097313   -6.800824
H 0    6.341065    0.698798   -6.696114
H 0    5.323797   -0.123580   -7.929882
H 0    6.419370    3.406737   -4.887479
H 0    6.494694    1.643283   -5.219378
H 0    5.919784    2.237146   -3.620425
H 0   -0.746321    3.620433   -7.489996
H 0    0.824753    3.564452   -6.616267
H 0   -0.568739    4.431843   -5.894359
H 0    2.388153   -7.456230   -3.657302
H 0    4.160563   -7.359733   -3.396217
H 0    3.478620   -7.128146   -5.041995
H 0    5.248560   -3.779878   -6.775278
H 0    5.199540   -4.684342   -5.225801
H 0    5.404084   -2.903771   -5.219042
H 0   -1.885278   -2.392181   -7.159215
H 0   -0.134774   -2.164589   -6.825916
H 0   -1.263121   -0.783085   -6.656141
H 0    3.590440   -3.046472    2.165138
H 0    3.522921   -3.502600    3.899537
H 0    2.046962   -2.902233    3.072301
H 0    4.369768   -6.389249    0.736070
H 0    5.144182   -5.656507   -0.707303
H 0    3.582561   -6.535358   -0.870069
H 0    0.564082   -9.415207   -1.370399
H 0    1.488144   -7.877015   -1.457488
H 0    0.344558   -8.306027   -2.765630
H 0   -0.317680   -2.038733    6.626806
H 0   -1.547880   -1.937841    7.929882
H 0   -1.504131   -0.685279    6.645263
H 0    0.588315   -5.362215    6.125059
H 0    0.455440   -3.593937    6.432849
H 0    1.455161   -4.194073    5.070436
H 0   -1.946851   -1.597996   -1.715010
H 0   -1.488975   -0.656875   -0.255870
H 0   -2.964843   -0.216125   -1.178675
H 0   -6.494694    1.269336    2.023744
H 0   -5.688246   -0.192703    2.693651
H 0   -4.698609    1.119759    1.961870
H 0    1.303426    2.999740    3.294510
H 0    2.325078    3.908750    4.457715
H 0    1.021352    4.756531    3.562555
H 0    1.883012   -0.360549    5.556893
H 0    1.778476    0.423575    3.943982
H 0    0.725741   -0.978706    4.331351
H 0    0.686630    7.862241   -0.279052
H 0    0.559057    8.055888    1.505227
H 0    0.117710    9.415207    0.419583
H 0    0.215770    6.239482    4.079072
H 0   -0.852695    7.584134    4.630325
H 0    0.204291    7.797720    3.188443
H 0   -5.255302    3.688722   -1.317463
H 0   -4.622879    5.239180   -0.684433
H 0   -6.190942    4.606652   -0.092022
H 0    6.154182    3.728431   -1.497880
H 0    5.724736    5.458308   -1.267219
H 0    5.873360    4.783272   -2.921082
H 0    2.859659    4.618386    1.329751
H 0    1.538069    5.822126    1.448380
H 0    3.245456    6.348891    1.648879
H 0    0.217383    7.790668   -5.752839
H 0    1.570422    7.702843   -4.585179
H 0    0.475472    9.122640   -4.578569

我从出错的提示看出好像是因为没有把原子标注清楚是属于哪一个分子的，可是我不知道应该怎么标清楚，所以还请高手可以指点一下，谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼2010-09-29 12:35:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

saradzj

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zhaojy008 at 2010-10-14 15:42:12:
你所给出的分子中原子个数与文件中原子总数不符啊！是不是分子结构有问题！

我的体系里面还定了两个哑原子的，会不会是那两个啊
赞一下 回复此楼
16楼2010-10-18 08:44:09
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答

manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人
★ ★
saradzj(金币+1):谢谢参与
saradzj(金币+5): 2010-09-30 09:43:07
heyo_123(金币+1):鼓励交流！！ 2010-09-30 09:47:55
0 2 0 1 0 2
C        0.000000    1.600184    0.000000 1
C        0.000000    0.960265    0.000000 1
N        0.208401    3.031919    0.000000 2
O        1.164068    3.666273    0.000000 2

0 2 0 1 0 2分别代表总体系电荷和多重度，片段一的电荷和多重度，片段二的电荷和多重度。

分子坐标后的1和2是定义的片段

参看http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1221421
赞一下(2人) 回复此楼
惺惺相惜情不自禁
2楼2010-09-29 12:44:01
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

saradzj

银虫 (小有名气)

BSSE错误

引用回帖:
Originally posted by manson1998 at 2010-09-29 12:44:01:
0 2 0 1 0 2
C        0.000000    1.600184    0.000000 1
C        0.000000    0.960265    0.000000 1
N        0.208401    3.031919    0.000000 2
O        1.164068    3.666273    0.000000 2

0  ...

谢谢，我按照上面的方法改了输入文件，是可以了，不过算了四个多小时后又出错了，不过是另外一个错误，麻烦你可不可以帮我看下，这个错误是什么原因导致的，应该怎样修改输入文件，谢谢！
输出文件最后几行如下：
Sum of Mulliken charges=   0.00000
Electronic spatial extent (au):  =117238.5273
Charge=     0.0000 electrons
Dipole moment (field-independent basis, Debye):
    X=    -5.3593    Y=   -11.2138    Z=     5.5254  Tot=    13.6015
Quadrupole moment (field-independent basis, Debye-Ang):
   XX=  -642.4822   YY=  -645.6191   ZZ=  -691.8276
   XY=    -0.5131   XZ=    16.8156   YZ=     4.4412
Traceless Quadrupole moment (field-independent basis, Debye-Ang):
   XX=    17.4941   YY=    14.3572   ZZ=   -31.8513
   XY=    -0.5131   XZ=    16.8156   YZ=     4.4412
Octapole moment (field-independent basis, Debye-Ang**2):
  XXX=  -782.1177  YYY=  -642.4474  ZZZ=    27.7624  XYY=   -48.5481
  XXY=  -294.9129  XXZ=   168.9530  XZZ=    93.7709  YZZ=  -112.7917
  YYZ=   190.7298  XYZ=    22.2309
Hexadecapole moment (field-independent basis, Debye-Ang**3):
XXXX=-66680.3184 YYYY=-59499.5551 ZZZZ=-21238.9823 XXXY=   255.5318
XXXZ=  1002.2809 YYYX=   682.3912 YYYZ=   327.1251 ZZZX=   -36.1265
ZZZY=  -164.3496 XXYY=-22026.1983 XXZZ=-15078.9929 YYZZ=-13520.2756
XXYZ=   190.0700 YYXZ=  -169.5530 ZZXY=  -330.0093
N-N= 2.993693357755D+04 E-N=-7.314484654457D+04  KE= 5.646384557010D+03
Leave Link  601 at Wed Sep 29 18:15:37 2010, MaxMem=   26214400 cpu:       7.0
(Enter C:\G03W\l122.exe)
Counterpoise: doing DCBS calculation for fragment   1 NewBq=T
Leave Link  122 at Wed Sep 29 18:15:38 2010, MaxMem=   26214400 cpu:       0.0
(Enter C:\G03W\l301.exe)
Basis read from rwf:  (6D, 7F)
No pseudopotential information found on rwf file.
The combination of multiplicity 1 and    89 electrons is impossible.
Error termination via Lnk1e in C:\G03W\l301.exe at Wed Sep 29 18:15:39 2010.
Job cpu time:  0 days  4 hours 24 minutes  8.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=   2643 Int=      0 D2E=      0 Chk=     36 Scr=      1
十分感谢！
赞一下 回复此楼
3楼2010-09-30 09:49:40
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人
saradzj(金币+5): 2010-10-08 11:20:17
可能有两种情况，一是关于你的.chk文件的，你是否用了改变了基组，导致你现在用的方法与你调用的chk文件中的方法不一致；二是你的多重度或者电荷输入不正确，检查一下。
赞一下 回复此楼
惺惺相惜情不自禁
4楼2010-09-30 10:05:44
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复(可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭