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Yolanda7

捐助贵宾 (正式写手)

[交流] 【求助】cif导入Materials studio后改变 已有2人参与

大家好,我导入一个ICSD #33243 关于BiVO4的cif文件到Materials Studio,gamma角却由90.387°变为90°,对称性也发生变化。而且手动改不过来。

而且,由Materials Studio导出的cif文件中的对称性、gamma角度都发生了相应的改变。

问题二:为什么Materials studio导出的cif文件信息比ICSD的要少。能否设置使其导出更多的cif信息?

问题三:为什么不同软件得到的cif文件信息不一样?我看到有的cif文件包含衍射、氢键等信息,而ICSD,Materials Studio导出的cif文件却没有?

有没有大侠解释下。谢谢。

这是ICSD的cif文件
data_33243-ICSD
...........
_cell_length_a                     5.197
_cell_length_b                     5.096
_cell_length_c                     11.702
_cell_angle_alpha                  90.
_cell_angle_beta                   90.
_cell_angle_gamma                  90.4
_cell_volume                       309.91
_cell_formula_units_Z              4
_symmetry_space_group_name_H-M     'I 1 1 2/b'
_symmetry_Int_Tables_number        15
_refine_ls_R_factor_all            .058
loop_
_symmetry_equiv_pos_site_id
_symmetry_equiv_pos_as_xyz
  1        '-x, -y+.5, z'
  2        'x, y+.5, -z'
  3        '-x, -y, -z'
  4        'x, y, z'
  5        '-x+.5, -y, z+.5'
  6        'x+.5, y, -z+.5'
  7        '-x+.5, -y+.5, -z+.5'
  8        'x+.5, y+.5, z+.5'
loop_
_atom_type_symbol
_atom_type_oxidation_number
Bi3+        3
O2-        -2
V5+        5
loop_
_atom_site_label
_atom_site_type_symbol
_atom_site_symmetry_multiplicity
_atom_site_Wyckoff_symbol
_atom_site_fract_x
_atom_site_fract_y
_atom_site_fract_z
_atom_site_occupancy
_atom_site_attached_hydrogens
_atom_site_B_iso_or_equiv
Bi1 Bi3+ 4 e 0 0.25 0.6337(1) 1. 0 -.064
V1 V5+ 4 e 0 0.25 0.1352(5) 1. 0 0.392
O1 O2- 8 f 0.149(3) 0.506(8) 0.210(2) 1. 0 0.43
O2 O2- 8 f 0.258(3) 0.379(8) 0.451(2) 1. 0 0.566

#End of data_33243-ICSD


这是由Materials Studio导出的cif文件

data_BiVO4-3
_audit_creation_date              2010-10-04
_audit_creation_method            'Materials Studio'
_symmetry_space_group_name_H-M    'C2/C'
_symmetry_Int_Tables_number       15
_symmetry_cell_setting            monoclinic
loop_
_symmetry_equiv_pos_as_xyz
  x,y,z
  -x,y,-z+1/2
  -x,-y,-z
  x,-y,z+1/2
  x+1/2,y+1/2,z
  -x+1/2,y+1/2,-z+1/2
  -x+1/2,-y+1/2,-z
  x+1/2,-y+1/2,z+1/2
_cell_length_a                    5.1970
_cell_length_b                    5.0960
_cell_length_c                    11.7020
_cell_angle_alpha                 90.0000
_cell_angle_beta                  90.0000
_cell_angle_gamma                 90.0000
loop_
_atom_site_label
_atom_site_type_symbol
_atom_site_fract_x
_atom_site_fract_y
_atom_site_fract_z
_atom_site_U_iso_or_equiv
_atom_site_adp_type
_atom_site_occupancy
Bi1    Bi    0.00000   0.25000   0.63370  -0.00081  Uiso   1.00
V1     V     0.00000   0.25000   0.13520   0.00496  Uiso   1.00
O1     O     0.14900   0.50600   0.21000   0.00545  Uiso   1.00
O2     O     0.25800   0.37900   0.45100   0.00717  Uiso   1.00

[ Last edited by Yolanda7 on 2010-9-29 at 11:37 ]
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喜洋洋~
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lfc85

金虫 (正式写手)

为什么用Materials Studio导出cif文件呢?
2楼2010-09-29 16:02:00
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Yolanda7

捐助贵宾 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by lfc85 at 2010-09-29 16:02:00:
为什么用Materials Studio导出cif文件呢?

只是初学Materials Studio,刚刚接触cif文件,弄着玩,却发现了上述不同。。。呵呵,期待大侠解释下。。。
喜洋洋~
3楼2010-09-29 16:27:36
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

Yolanda7(金币+3): 2010-09-30 17:44:41
的确会。
可以点build crystal, 选择正确的空间群
xi2004-emuch@163.com
4楼2010-09-29 16:49:33
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Yolanda7

捐助贵宾 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2010-09-29 16:49:33:
的确会。
可以点build crystal, 选择正确的空间群

请问,您知道unique axis是什么意思吗?
喜洋洋~
5楼2010-09-29 22:14:52
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orpheus

铜虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请教如何导入CIF文件呀?
simple person, simple life.
6楼2015-05-15 17:38:45
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
本帖内容被屏蔽

7楼2021-05-04 00:12:30
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