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D调华丽

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】大家帮忙看下 ~~~我提的 基因组DNA~ 有问题么? 已有3人参与

大家帮忙看下 ~~~我提的 基因组DNA~  有问题么? mark是7000的,
要从里面P一段1500bp的片段,怎么PCR老是只有小于500bp的小片段?
请知情人解答下~谢谢!
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人生一场就是在不同的时候竖起不同的手指~
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D调华丽

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zking5129 at 2010-09-28 14:58:55:
DNA没有问题,我们提的也是这个样子。所谓的500bp的PCR产物你确定不是引物二聚体吗?如果是PCR的产物,那你的DNA可能降解了或者引物设计有问题。如果是引物二聚体,那么就是没有P出来,可以考虑优化条件再P。

谢谢,那引物二聚体怎么确定呢?
人生一场就是在不同的时候竖起不同的手指~
3楼2010-09-28 20:13:59
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zking5129

铁虫 (初入文坛)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
scelab(金币+2):欢迎多来交流!:tiger06: 2010-09-28 22:54:41
DNA没有问题,我们提的也是这个样子。所谓的500bp的PCR产物你确定不是引物二聚体吗?如果是PCR的产物,那你的DNA可能降解了或者引物设计有问题。如果是引物二聚体,那么就是没有P出来,可以考虑优化条件再P。
2楼2010-09-28 14:58:55
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weiwei_yn

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
用相应的软件可以看看你的引物!
hoopisagoodthing
4楼2010-09-28 22:08:39
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D调华丽

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by weiwei_yn at 2010-09-28 22:08:39:
用相应的软件可以看看你的引物!

用oligo测了二聚体能量最大的是-12.9kcal/mol,好像也不是太高吧~
人生一场就是在不同的时候竖起不同的手指~
5楼2010-09-28 23:19:13
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