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D调华丽

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】大家帮忙看下 ~~~我提的 基因组DNA~ 有问题么？ 已有3人参与

大家帮忙看下 ~~~我提的 基因组DNA~  有问题么？ mark是7000的，
要从里面P一段1500bp的片段，怎么PCR老是只有小于500bp的小片段？
请知情人解答下~谢谢！
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人生一场就是在不同的时候竖起不同的手指~
1楼 2010-09-27 16:32:53
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zking5129

铁虫 (初入文坛)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
scelab(金币+2):欢迎多来交流！:tiger06: 2010-09-28 22:54:41
DNA没有问题，我们提的也是这个样子。所谓的500bp的PCR产物你确定不是引物二聚体吗？如果是PCR的产物，那你的DNA可能降解了或者引物设计有问题。如果是引物二聚体，那么就是没有P出来，可以考虑优化条件再P。
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2楼2010-09-28 14:58:55
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D调华丽

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by zking5129 at 2010-09-28 14:58:55:
DNA没有问题，我们提的也是这个样子。所谓的500bp的PCR产物你确定不是引物二聚体吗？如果是PCR的产物，那你的DNA可能降解了或者引物设计有问题。如果是引物二聚体，那么就是没有P出来，可以考虑优化条件再P。

谢谢，那引物二聚体怎么确定呢？
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人生一场就是在不同的时候竖起不同的手指~
3楼2010-09-28 20:13:59
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weiwei_yn

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
用相应的软件可以看看你的引物！
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hoopisagoodthing
4楼2010-09-28 22:08:39
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D调华丽

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by weiwei_yn at 2010-09-28 22:08:39:
用相应的软件可以看看你的引物！

用oligo测了二聚体能量最大的是-12.9kcal/mol，好像也不是太高吧~
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人生一场就是在不同的时候竖起不同的手指~
5楼2010-09-28 23:19:13
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