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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【讨论】DS --3D QSAR pharmacophore
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mazhayazi

银虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】DS --3D QSAR pharmacophore

大家好，有点问题想请教你们。我在用DS2.1做3D QSAR pharmacophore.是这样做的：
1.用chembio3d这个画图软件 画出训练集3d结构
2.在ds中添加activ uncert 这两个参数
3.在ds中用Diverse Conformation Generation 产生构想
4.在ds中用Ligand minimization能量最小化
5.3D QSAR pharmacophore generation得出药效团
不知道这个过程对不对啊，请指正，谢谢
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1楼 2010-09-25 18:01:42
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blue_cat

木虫 (正式写手)
★ ★
mazhayazi(金币+1):O(∩_∩)O~谢谢指导。。。 2010-09-27 09:51:16
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-09-27 12:36:43
应该把能量最小化放在产生多构象之前进行。
赞一下(1人) 回复此楼
DS
2楼2010-09-27 08:58:47
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精业济群

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问uncert是怎样确定的
赞一下 回复此楼
加油！！！！
3楼2016-06-11 00:58:45
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