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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2025级博士研究生招生报考通知
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zhaojy008

金虫 (小有名气)

彩色风

[交流] 【求助】用MS中CASTP模块优化TiO2的101面,计算失败问题

用MS中CASTP模块优化总共含有32个Ti和64个氧原子的TiO2的101面,计算总是刚开始就失败,不知是什么原因,请教各位大师
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彩色风
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ym23

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
zhaojy008(金币+1):谢谢参与
zhaojy008(金币+1): 2010-09-26 08:47:07
zzy870720z(金币+1):谢谢 2010-09-27 22:47:37
引用回帖:
Originally posted by zhaojy008 at 2010-09-25 10:54:36:
用MS中CASTP模块优化总共含有32个Ti和64个氧原子的TiO2的101面,计算总是刚开始就失败,不知是什么原因,请教各位大师

刚开始是多长时间,是一两分钟还是几秒钟?
如果是几秒钟可能与license失效有关,如果是一两分钟,那可能是内存严重溢出。
请给出错误信息。
博观约取、厚积薄发---壁立千仞、无欲则刚
2楼2010-09-25 23:44:37
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zhaojy008

金虫 (小有名气)

彩色风

十分感谢。有时一两分钟,有时几秒。我把一两分钟失败的文件看了一下也搞不明白,也许是内存严重溢出的问题。贴在下面:请帮助解决。

  Centre of mass is NOT constrained

                         Number of cell constraints= 6
                         Cell constraints are:  0 0 0 0 0 0

                         External pressure/stress (GPa)
                          0.00000   0.00000   0.00000
                                    0.00000   0.00000
                                              0.00000
+---------------- MEMORY AND SCRATCH DISK ESTIMATES PER NODE -------------+
|                                                     Memory          Disk    |
| Model and support data                             1067.2 MB       125.6 MB |
| Electronic energy minimisation requirements         824.0 MB       645.8 MB |
|                                               ----------------------------- |
| Approx. total storage required per node            1891.2 MB       771.5 MB |
|                                                                             |
| Requirements will fluctuate during execution and may exceed these estimates |
+-----------------------------------------------------------------------------+
Out of RAM for coeffs in wave_allocate_wv
Current trace stack:
wave_allocate_wv
electronic_initialise
electronic_minimisation
check_elec_ground_state
castep
彩色风
3楼2010-09-26 08:45:39
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truemantwo

木虫 (正式写手)

★ ★
zhaojy008(金币+1):谢谢参与
aylayl08(金币+1):感谢提示 2010-09-28 10:06:39
会不会是原子数太多咯?CASTEP算不动,我也在算这个,只不过总共只有48个原子,本来是在dmol3里面优化的,但是优化的能量曲线一直在上下震荡不收敛,就换到CASTEP计算了,但是进展好慢呀,快一天了,还只是第一步不晓得计算切面应该注意些什么
4楼2010-09-26 08:48:28
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zuozhijun5134

至尊木虫 (文坛精英)

★ ★
zhaojy008(金币+1):谢谢参与
zxzj05(金币+1):谢谢回帖交流 2010-09-27 13:16:45
我觉得可能是原子数过多
5楼2010-09-26 09:01:09
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zhaojy008

金虫 (小有名气)

彩色风

回复三楼:不是。CASTEP计算时直接给出了失败的信息。不是慢的问题。我看的文献中算了48个Ti和96个O原子的TiO2,他们也进行了101切面。还是在04年做的。
彩色风
6楼2010-09-26 09:01:24
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gongjijun

木虫 (正式写手)


zhaojy008(金币+1):谢谢参与
你的机子内存多大?
7楼2010-09-26 09:13:48
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zhaojy008

金虫 (小有名气)

彩色风

回复6楼:谢谢关心。3G
彩色风
8楼2010-09-26 09:28:54
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truemantwo

木虫 (正式写手)

3G内存 CASTEP 计算?太神奇了吧,能算吗?
9楼2010-09-26 09:53:07
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truemantwo

木虫 (正式写手)


aylayl08(金币+1):感谢回复讨论 2010-09-28 10:07:05
引用回帖:
Originally posted by zhaojy008 at 2010-09-26 09:01:24:
回复三楼:不是。CASTEP计算时直接给出了失败的信息。不是慢的问题。我看的文献中算了48个Ti和96个O原子的TiO2,他们也进行了101切面。还是在04年做的。

能否把那文章分享一下,他是用CASTEP计算的吗?你试过用DMOL3优化吗?我觉得还是你内存太小了,原子数又那么多,他们能算也许是内存大些,或者一些参数设置的原因,我也一直在找原因,切面应该多大也不知道,头痛!
10楼2010-09-26 10:20:50
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