应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 个人文集 » 【cxyuan09个人文集】一个在linux下批量产生cube文件的小程序
11/1返回列表
查看: 1917  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
【奖励】 本帖被评价8次，作者cxyuan09增加金币 6.7 个
本帖产生 1 个 QC强帖 ，点击这里进行查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

cxyuan09

金虫 (正式写手)

[资源] 【cxyuan09个人文集】一个在linux下批量产生cube文件的小程序

由于linux生成cube（可以用GV读入.cube文件直接画分子轨道）的速度比在windows下快得多，如果要画大量的分子轨道，可以用本程序在linux批量产生。

程序内容如下：

#!/bin/csh
foreach j ( $argv )
@ i=27
while ( $i <= 39 )
cubegen 0 mo=$i $j.fchk ${j}_$i.cube 0 h
@ i++
end
end

使用方法：
1、在linux下创建程序文件： 比如命名为mos.csh
2、把上述程序内容粘贴进去，保存退出
3、为程序增加可执行属性：  chmod +x mos.csh
4、程序执行方式：
./mos.csh filename

注意：
1、filename不用加扩展名.fchk，
2、需要事先将chk文件转化为fchk文件，批量转化chk文件可参考我之前一个帖子中我回复的内容
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2082151&fpage=1&view=&highlight=&page=2


本例中，将产生某分子从第21低能量的轨道到第39低能量的轨道，大家可以根据需要修改。

如果有很多同分异构体，需要看它们的价轨道，可以多输入几个文件名，使用方式：
./mos.csh filename1 filename2 filename3 ......

注意：filename不用加扩展名“.fchk”

如果觉得有用，别忘了五星支持啊！

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-9-25 at 15:09 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

量化软件学习

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-09-21 21:37:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 cxyuan09 的主题更新
11/1返回列表
☆ 无星级 ★ 一星级 ★★★ 三星级 ★★★★★ 五星级
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭