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1楼 2010-09-16 15:28:52

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yeguxing

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Originally posted by duckula7708 at 2010-09-17 15:38:01:
先扩增16S rDNA 测序比较，基本可以定到相应的属，如果要鉴定到种的话就需要做杂交和生理生化方面的实验。如果是新种还要做细胞化学组分分析，如细胞壁糖、全细胞脂肪酸、肽聚糖结构、一些脂类、醌等等。

我的目的是先鉴定到属，你那有详细的步骤吗？

10楼2010-09-17 18:42:09

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sfxt001

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抽基因组，用通用16S引物扩增其16S rDNA序列，克隆测序，登录NCBI或者rdp上传该序列进行16S分类分析，即可知道该菌的种属分类。

2楼2010-09-16 15:41:01

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hopebiolqdhb

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盲样吗？是什么来源的细菌

培养基

3楼2010-09-16 16:38:52

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yeguxing

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Originally posted by hopebiolqdhb at 2010-09-16 16:38:52:
盲样吗？是什么来源的细菌

从土壤中提取的抗砷菌

4楼2010-09-16 17:05:15

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yeguxing

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Originally posted by sfxt001 at 2010-09-16 15:41:01:
抽基因组，用通用16S引物扩增其16S rDNA序列，克隆测序，登录NCBI或者rdp上传该序列进行16S分类分析，即可知道该菌的种属分类。

请问有详细步骤吗？我是环境科学的，对这个完全不懂。谢谢了

5楼2010-09-16 17:06:11

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不好意思，我只懂从动物体分离病原菌

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6楼2010-09-16 17:19:04

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hopebiolqdhb

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lstt09nk(金币+1):感谢提供~ 2010-09-17 17:27:54

http://www.hopebiol.com/asphtml/refere3431.htm
该论文是关于新疆抗砷菌分离的

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7楼2010-09-17 09:18:01

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duckula7708

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lstt09nk(金币+1):感谢交流~ 2010-09-17 17:28:14

先扩增16S rDNA 测序比较，基本可以定到相应的属，如果要鉴定到种的话就需要做杂交和生理生化方面的实验。如果是新种还要做细胞化学组分分析，如细胞壁糖、全细胞脂肪酸、肽聚糖结构、一些脂类、醌等等。

8楼2010-09-17 15:38:01

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看天(金币+1):对 2010-09-17 19:49:38

精确的鉴定菌株只用16S好像不够，应该用至少3种分子生物学的方法，才可以说明问题