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362720651

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】更改源代码 并行出问题 已有6人参与

我最近对lammps中 deposit的源代码进行了更改,然后编译运行在我的单核上都没问题,但在集群服务器上,就不能输出dump,运行会自动终止,也不报错,log文件变空白。但在单机运行是没问题的,自己解决了好久也不知道问题出在哪里,不知道有没有前辈有类似的经验。
我在deposit源文件中增加的代码如下:
int i,j;
>  int flag,flagall;
>  double coord[3],lamda[3],delx,dely,delz,rsq;
>  double *newcoord;
>  double **x = atom->x;
>  int    *mask = atom->mask;
>  int    nlocal = atom->nlocal;
>  int    natoms;
>  int    data = 0;
>  Region *region = domain->regions[iregion];
>
>  for(int i=0; i< nlocal ; i++) {
>    if (mask && groupbit && region->match(x[0],x[1],x[2]))  data += 1;
>  }
>  MPI_Allreduce(&data,&natoms,1,MPI_INT,MPI_SUM,world);
感觉就算其中涉及到并行问题的代码,也就是最后一句,都是模仿lammps源代码编写的,不知道问题出在哪里。
希望前辈能给予指点,万分感谢 谢谢了!!
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清风独立

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
您好,请问你的代码是直接加在源程序里面吗?还要做其他修改吗?
10楼2017-11-25 13:22:31
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