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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 【求助】三个A类错误的修改
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tong111111

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助】三个A类错误的修改 已有2人参与

Alert level A
RFACR01_ALERT_3_A  The value of the weighted R factor is > 0.45
            Weighted R factor given   0.501
PLAT084_ALERT_2_A High wR2 Value .................................       0.50      
PLAT601_ALERT_2_A Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .     235.00 A**3
怎么可以改过来啊？
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奋斗的人生绽放活力
1楼 2010-09-09 23:57:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cfocus20

至尊木虫 (职业作家)
★
nash603(金币+1):谢谢回贴交流！ 2010-09-10 08:53:41
tong111111(金币+5): 2010-09-10 20:04:58
RFACR01_ALERT_3_A  The value of the weighted R factor is > 0.45
            Weighted R factor given   0.501
PLAT084_ALERT_2_A High wR2 Value .................................       0.50      

Check 你的Z 值和你分子內原子數目

Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of  XXX

這個你有用squeeze 指令,請把xxx.sqz檔案內容
copy至xxx.cif檔案
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Smart_work_and_beautiful_life!
2楼2010-09-10 00:13:39
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caty

至尊木虫 (著名写手)

小木虫潜水俱乐部名誉主席
★
nash603(金币+1):谢谢回贴交流！ 2010-09-10 08:53:47
tong111111(金币+5): 2010-09-10 20:05:02
RFACR01_ALERT_3_A  The value of the weighted R factor is > 0.45
            Weighted R factor given   0.501
PLAT084_ALERT_2_A High wR2 Value .................................       0.50      
和Z 值和分子內原子數目应该无关。仔细检查精修是否完成、模型有无错误、是否孪晶，另外一个很大的可能性是数据不好，可以重新挑一个质量好的晶体收集数据，必要时可以考虑低温测试。
赞一下(1人) 回复此楼
谋事在人，成事在天
3楼2010-09-10 01:53:00
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linhua0402313

版主 (文坛精英)
★
nash603(金币+1):谢谢回贴交流！ 2010-09-10 08:53:55
tong111111(金币+5): 2010-09-10 20:05:07
从你的错误看，你的晶体解析根本还没有完成，R1和WR2值都非常的大，这样的数据进行cif check是没有任何意义的，同样对出现的错误进行的修改也没有任何意义，建议重新解析结构，等所有数值都符合要求了再进行check
赞一下(1人) 回复此楼
身在高山独抚琴，心随流水会知音
4楼2010-09-10 08:43:23
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文言文

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by cfocus20 at 2010-09-10 00:13:39:
RFACR01_ALERT_3_A  The value of the weighted R factor is > 0.45
            Weighted R factor given   0.501
PLAT084_ALERT_2_A High wR2 Value .................................       0.50      
...

高手，您好！
Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of  XXX

這個你有用squeeze 指令,請把xxx.sqz檔案內容
copy至xxx.cif檔案
为什么要这样处理空洞了，而不是把溶剂分子指认出来呢？谢谢您！
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2010-09-14 14:41:16
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cfocus20

至尊木虫 (职业作家)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
nash603(金币+1):谢谢回贴交流！ 2010-09-14 17:12:41
引用回帖:
Originally posted by 文言文 at 2010-09-14 14:41:16:

高手，您好！
Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of  XXX

這個你有用squeeze 指令,請把xxx.sqz檔案內容
copy至xxx.cif檔案
为什么要这样处理空洞了，而不是把溶剂分子指认出来呢？谢谢您！

因為照這個版主所使用的指令是用platon->squeeze->將j未解完的溶劑分子Q峰去除再進行精修,所以必須將所忽略的Q封內容複寫至cif!! 以說明解晶過程所使用程序與指令!

當然如果Q峰可以解出可以不用此指令進行精修!
赞一下(2人) 回复此楼
Smart_work_and_beautiful_life!
6楼2010-09-14 16:14:36
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