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PubMed的检索使用方法
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以 PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术 信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH）的平台上。首先了解主页面的内容： 主界面的左侧框有： 1．Journal Browser 期刊浏览 2．MeSh Browser可以用它来分层流览MeSH表 3．Single Citation Matcher输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容 4．Batch Citution Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。 5．Clinical Queries这一部分为临床医生设置，通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围：治疗、诊断、病原学与预后。 Related Resources 1．Order document.可以使用户在当地得到文献的全文， 但这是要收费的。 2．NLM Mobile：可利用流动的手机进行查询的服务。 3．NLM Catalog：期刊具体详细信息。 4．NLM Gateway：数据库入口 5．TOXNET：提供了毒理学，危险化学药品，环境健康以及有毒物质释放的数据库 6．Consumer Health提供与Medline plus的链接，Medline plus是与消费者健康信息相关的国家医学图书馆的网络节点。 7．Clinical Alerts此部分的目的是加快NIH资助的临床研究成果公布 8．ClinicalTrials.gov：提供了关于政府或者私人支持的在 自愿者上进行的临床研究最新信，能够告诉你进行该研究的 参与者，位置以及电话等一系列详细信息。 9．PubMed Central：是美国国家健康研究所提供的一个关于生物医学和生命科学的全文免费期刊库。 简单检索 我们登陆PUBMED检索系统主页,在页面上部的检索框中输入检索词或几个检索词，然后单击"go"按钮或按回车键，PubMed将会自动开始检索，并将检索到的相关条目显示在屏幕上。在检索框前面，你还可以选定所要检索内容的数据库范围，除NCBI的数据库以外，可供选择的还有：PROTEIN, STRUCTURE, POPSET等等。 注意：首先：在检索时，要明确检索的关键词，同时要考虑到关键词的同义词，还可以利用限定时间和研究团队来精简检索范围。 其次：利用布尔运算提高检索效率，最常用的三种：是and，or和not 检索类型： 1. 主题检索: 在检索框中键入英文单词或短语（大写或小写均可）。然后回车或点击"Go" 2. 作者检索：格式：格式为："著者姓 空格 名字首字母缩写" 3．刊名检索：可以输入期刊全名，也可输入期刊简写或期刊的ISSN号 4．日期范围检索：日期的录入格式为YYYY/MM/DD；如：2005/09/08 也可以不录月份和日子，如：2005或2005/09。 5．检索带文摘的记录：格式：检索词AND has abstract 6．布尔逻辑检索：利用 and or not定义检索。 检索结果： 检索结果默认的显示方式：是Summary格式，每页20条记录，以时间倒序排列。显示作者，文章题目，以及文章来源的一些信息：如下例： Display SummaryBriefAbstractCitationMEDLINEXMLUI ListLinkOutASN.1Related ArticlesCited ArticlesCited in BooksCancerChrom LinksDomain Links3D Domain LinksGEO DataSet LinksGene LinksGene (GeneRIF) LinksGenome LinksProject LinksGENSAT LinksGEO Profile LinksHomoloGene LinksNucleotide LinksOMIA LinksOMIM LinksBioAssay LinksCompound LinksCompound via MeSHSubstance LinksSubstance via MeSHPMC LinksCited in PMCPopSet LinksProbe LinksProtein LinksSNP LinksStructure LinksUniGene LinksUniSTS Links Show 5102050100200500 Sort byAuthorJournalPub Date Send toTextFileClipboardE-mailRSS FeedOrder 1: Gloro R, Hourmand-Ollivier I, Mosquet B, Mosquet L, Rousselot P, Salame E, Piquet MA, Dao T. Related Articles, Links Fulminant hepatitis during self-medication with hydroalcoholic extract of green tea. Eur J Gastroenterol Hepatol. 2005 Oct;17(10):1135-1137. PMID: 16148563 [PubMed - as supplied by publisher] 我们可以通过点击Display 选择其他的显示格式，同时在show后的下拉菜单选择每页的显示数量可进行5-10-20-50-100-200最多每页显示500条数据。Sort by 可以利用检索结果的作者，其刊名或更新时间来进行排序显示。 如果只显示其中的一条记录，点击所选的记录的题目进入查看详细的信息：可以看到文章的数据库链接，相链接的数据库如果我们已经购买，就可以看到全文。Pubmed只提供相应的摘要。 高级检索 进入PubMed首页之后，在快速检索框的下方，有五个重要的功能按钮，即Limits按钮, Preview/Index按钮, History按钮, Clipboard按钮,及Details按钮。 All Databases PubMed Nucleotide Protein Genome Structure OMIM PMC Journals Books Search PubMedProteinNucleotideStructureGenomeBooksCancerChromosomesConserved Domains3D DomainsGeneGenome ProjectGENSATGEO ProfilesGEO DataSetsHomoloGeneJournalsMeSHNCBI Web SiteNLM CatalogOMIAOMIMPMCPopSetProbePubChem BioAssayPubChem CompoundPubChem SubstanceSNPTaxonomyUniGeneUniSTSfor Limits Preview/Index History Clipboard Details 简单了解一下这几个按钮的主要功能： 1.limis 当你单击Limits按钮后，你可以看到如下界面。 Limited to: AffiliationAll FieldsAuthorCorporate AuthorEC/RN NumberEntrez DateFilterFirst AuthorFull Author NameGrant NumberIssueJournalLanguageMeSH DateMeSH Major TopicMeSH SubheadingMeSH TermsPaginationPharmacological ActionPublication DatePublication TypeSecondary Source IDSubstance NameText WordTitleTitle/AbstractVolume only items with abstracts Publication TypesClinical TrialEditorialLetterMeta-AnalysisPractice GuidelineRandomized Controlled TrialReview LanguagesEnglishFrenchGermanItalianJapaneseRussianSpanish SubsetsAIDSBioethicsCancerComplementary MedicineCore clinical journalsDental journalsHistory of MedicineMEDLINENursing journalsOLDMEDLINE for Pre1966PubMed CentralSpace Life SciencesToxicology AgesAll Infant: birth-23 monthsAll Child: 0-18 yearsAll Adult: 19+ yearsNewborn: birth-1 monthInfant: 1-23 monthsPreschool Child: 2-5 yearsChild: 6-12 yearsAdolescent: 13-18 yearsAdult: 19-44 yearsMiddle Aged: 45-64 yearsMiddle Aged + Aged: 45+ yearsAged: 65+ years80 and over: 80+ years Humans or AnimalsHumansAnimals GenderFemaleMale Entrez Date30 Days60 Days90 Days180 Days1 Year2 Years5 Years10 Years Publication DateEntrez DateFromTo Use the format YYYY/MM/DD; month and day are optional. All Fields: 将搜索范围设定在一个特定的域。 Ages,humans and animal,gender: 将搜索范围设定在特定的年龄组、性别组、人类或动物学范围。 Publication types: 搜索限定在某一语种出版的或某一特定的文章类型（如综述）。 Only items with abstracts: 设定只搜索包含摘要的文献。 Entrez date: 设定搜索Entrez数据库或Publication数据库。 Subsets: 设定搜索范围为PubMed数据库的某一子数据库（如Abridged Index Medicus 或AIDS相关的条目） 2．Preview/Index 按钮 在按下Preview/Index按钮之后，我们可以进行的设定有： 1.在显示条目之前显示所查到的文献数。 2. 随时通过增加查询单词来修改查询方案。 3. 在特定的搜索域中向方案里加入查询词。 4. 从Index中查看并选择词语来修改查询方案。 5. 在你修改查询时查看方案。 Preview(预览) 使用此功能可以在显示条目之前显示所查到的文献数。使用时，在输入框中键入搜索词，然后单击Preview，PubMed返回的信息是条目的数量。 Index（索引）使用此功能,可以从特定域中选择以索引的单词，并把他们加入查询方案之中;可以查看某一个特定搜索域中词语列表；也可以使用布尔运算符来建立一个查询方案。 3．History 按钮 History （历史记录）历史记录中保存的是你所有的查询方案与查询结果，只有当你运行了一次查询之后，History中才有内容。History屏幕将会显示：你的查询方案、查询时间、查询到的文献数量。Preview显示的是历史记录中最近的三条记录，而使用History可以看到最近100次的查询结果。一旦查询数量超过100，PubMed会将最早的查询除去，加进最新的一次查询。如果两次查询内容相同，PubMed会将头一次的去除。 4．Clipboard 按钮 剪贴板可以帮助你保存或查看在一个或多个查询中选择的条目，然后就可以打印、保存、订购剪切板中的内容了。将条目左边的复选框选中，单击"Add to clipboard"就可以将其加入剪切板中。当点击 Clear History可以将History中的所有内容清除。剪切板中最大的储存数是500条。而放在剪切板中的内容如果在一小时内没有任何操作，将会自动消失。 5．Details 按钮 Query Translation: reticulata[All Fields] Result: 2222 Database: PubMed User query: reticulata Details是用于帮助你查看PubMed的检索策略。即在提问框中键入的检索词被PubMed用Details键可以对检索策略进行编辑，然后再一次检索。在Query Translation框内显示的是PubMed实际使用的检索策略和语法。该框下有三个区域：Result区显示检索结果的记录总数，点击这个数字，可回到检索结果显示屏；Database区显示检索的数据库；User Query 区显示用户键入的检索词或检索式。 要对检索策略进行编辑可直接点击Query Translation框中的检索策略，将其增加、删除或修改后点击Search键。 除了以上五个主要功能键以外，利用PubMed提供的其他一些功能，如MeSH 等。 全文索取 1．PubMed PubMed上约有5％的文献是可以免费看到全文的，通常这些文献的左上角会有一个Free Full Text的小标记。你只要点击这个图标，系统就自动链接入该文献的全文。但有两点值得注意的是，第一，很多时候，这个图标在PubMed处于显示简要（summary)状态下并不出现，而只有在选择显示摘要（abstract)时才出现。因此，如果你不只是泛泛浏览，而希望看到全文的话，在display下拉菜单中选择摘要（abstract)状态。第二，有些时候，小图标上仅标着Full Text，而并没有Free字样，但仍然可以链接，很多链接到我们所购买的数据库中。 2．免费提供全文的期刊 部分网上免费全文期刊如：PNAS， PMC journals, DOAJ数据库都是网络免费的数据期刊库。 ★ 说明：在网站中出现的SUBSET是子集的意思，是指数据库中包含的子集数据库。 转自:http://www.kib.ac.cn/lib/2005/9-14/102254.htm |
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