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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】MS最小化和动力学以后
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zxm86

金虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】MS最小化和动力学以后 已有3人参与

我是MS 新手，请求各位大侠帮助
    我在Modules-----Amorphons Cell---Construction下建立盒子后在Discover--Minimize下进行最小化，设置的时间步数是5000，可是每次都是运行到1000左右的时候就自行结束了,这是怎么回事啊？而且进行Dynimics 优化时，我设置的优化步数是1000ps，可是每次运行到8-9个ps时，盒子里的分子就不再随着优化步数变动了，这个又是什么原因啊？
   还有啊，Modules-----Amorphons Cell---Construction下的Minimize、Dynimics 和Discover下的Minimize、Dynimics 有什么区别啊？？？
  再次求助各位大侠
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1楼 2010-09-07 20:37:12
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siga5609

木虫 (小有名气)
★ ★
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zzy870720z(金币+1):谢谢回复 2010-09-10 12:19:15
1000步就结束说明你所定的收敛条件就达到了。5000步是最多的步骤，不一定要跑完。

“而且进行Dynimics 优化时，我设置的优化步数是1000ps，可是每次运行到8-9个ps时，盒子里的分子就不再随着优化步数变动了”指的是你眼睛看的么？只要程序还在跑就没问题。
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愚蠢的地球人，受死吧！哇哈哈哈……
2楼2010-09-09 23:53:54
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zxm86

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by siga5609 at 2010-09-09 23:53:54:
1000步就结束说明你所定的收敛条件就达到了。5000步是最多的步骤，不一定要跑完。

“而且进行Dynimics 优化时，我设置的优化步数是1000ps，可是每次运行到8-9个ps时，盒子里的分子就不再随着优化步数变动了”指 ...

那个收敛条件在哪儿设定的啊，我记得以前最小化时都是5000跑完的，现在跑几百就停了，请大侠再指教一下
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3楼2010-09-12 16:59:54
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siga5609

木虫 (小有名气)
★ ★ ★
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mazuju028(金币+2):谢谢交流 2010-09-13 21:25:33
模型不同的话，最小化需要的步数会有所不同。
你要让它跑久点可以“Fine”或者“Ultra-Fine”或者自定义么……
收敛条件是在最小化的“more”菜单里定的，但是一般都不怎么改。
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愚蠢的地球人，受死吧！哇哈哈哈……
4楼2010-09-13 17:44:28
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xdr

金虫 (正式写手)
★
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引用回帖:
Originally posted by zxm86 at 2010-09-07 13:37:12:
我是MS 新手，请求各位大侠帮助
    我在Modules-----Amorphons Cell---Construction下建立盒子后在Discover--Minimize下进行最小化，设置的时间步数是5000，可是每次都是运行到1000左右的时候就自行结束了,这是 ...

要优化1000ps这么多吗？这是根据什么设定的呢？
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5楼2010-10-01 15:57:15
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