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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】linux下查看优化的分子结构的问题
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zhanping

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】linux下查看优化的分子结构的问题

　　本人用台式机向服务器交送运算程序，最后由于台式机要用，直接搬走了，现在程序在linux上运行，只是出现收敛问题，我想在优化的基础上改一下，可是在linux上又找不到图，怎么办？
       也就是想知道那个文件里存储的优化后的结构，如何查看？

       大家有没有遇到这样的情况？

       忘了，用的是MS的castep
      下面是linux下运行后的数据，那个里面放着优化后的结构啊？怎样 打开查并修改啊？
     谢谢了 ！


        谢谢大家了！ 有重谢！

[ Last edited by zhanping on 2010-9-5 at 10:36 ]
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1楼 2010-09-04 21:09:39
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zhanping

金虫 (正式写手)
其实就是想知道Linux下优化的结构在哪个文件里，怎样得到该数据，怎样打开？
谢谢了！
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2楼2010-09-05 01:13:48
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longchang

金虫 (小有名气)
★ ★
zhanping(金币+1):谢谢参与
zzy870720z(金币+1):谢谢回复，楼主想要结果文件，呵呵 2010-09-05 15:37:05
进入你装MS的用户下，cd ~回到主目录,然后进入Accelrys(类似的文件夹,看你怎么装的),我的路径是 /Accelrys/ MaterialsStudio43/etc/Gateway/ root_default/dsd/jobs,可能安装路径不一样，关键找到etc。要想打开并修改数据，最好还是传到一个单击上，直接在MS上修改，要想在linux下修改，怎样修改和提交任务，我就不会了，呵呵，希望对你有用！
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3楼2010-09-05 08:30:49
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zhanping

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by longchang at 2010-09-05 08:30:49:
进入你装MS的用户下，cd ~回到主目录,然后进入Accelrys(类似的文件夹,看你怎么装的),我的路径是 /Accelrys/ MaterialsStudio43/etc/Gateway/ root_default/dsd/jobs,可能安装路径不一样，关键找到etc。要想打开并 ...

我在linux下运行的数据已传上，没有找到etc文件啊？ 是不是再提交任务是需要设置，还是在其他文件里！谢谢了！
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4楼2010-09-05 10:37:48
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solarman

新虫 (正式写手)
★ ★
zhanping(金币+1):谢谢参与
zzy870720z(金币+1):谢谢指教 2010-09-05 15:37:14
zhanping(金币+1): 2010-10-27 14:03:14
引用回帖:
Originally posted by zhanping at 2010-09-04 21:09:39:
　　本人用台式机向服务器交送运算程序，最后由于台式机要用，直接搬走了，现在程序在linux上运行，只是出现收敛问题，我想在优化的基础上改一下，可是在linux上又找不到图，怎么办？
       也就是想知道那个文 ...

后缀名为.castep的文件为你的结果文件，在最后一步SCF后，会显示出优化后的体系坐标
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5楼2010-09-05 13:49:49
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solarman

新虫 (正式写手)
zhanping(金币+1): 2010-10-27 14:03:12
引用回帖:
Originally posted by zhanping at 2010-09-05 01:13:48:
其实就是想知道Linux下优化的结构在哪个文件里，怎样得到该数据，怎样打开？
谢谢了！

你可以把结果文件中的优化坐标拷贝到cell文件中，然后直接命令执行你的输入文件，继续开始优化。
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6楼2010-09-05 13:52:30
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shuo2008

金虫 (正式写手)
★
zhanping(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by solarman at 2010-09-05 13:52:30:

你可以把结果文件中的优化坐标拷贝到cell文件中，然后直接命令执行你的输入文件，继续开始优化。

好像将.castep文件考下来，然后Update一下就好了 1

[ Last edited by shuo2008 on 2010-9-5 at 21:14 ]
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7楼2010-09-05 21:13:39
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