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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】以前没见到过的Gaussian错误？？
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erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】以前没见到过的Gaussian错误？？ 已有4人参与

在LINUX系统下计算的，不知道什么时候出现
fclose of exec file failed.read from file GXX-Exec.Dat failed
Returned from execl,istat=-1,errno=2!
Returned from execl!

这个错误。


   请高手看下，谢谢
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1楼 2010-09-04 08:59:23
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
★ ★ ★ ★ ★ ★
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erylingjet(金币+5):谢谢！ 2010-09-04 10:36:24
Your calculations are failing because of a 'Stale NSF file handle.'
This is common when reading and writing your Gaussian scratch files to
a network drive (NSF mounted) and the NSF server cannot keep up with
the requests.  The scratch files are written to the users home
directory (or other location) on a NSF mount instead of to the node's
local scratch directory (local hard drive).  Storing your Gaussian
files (input, output, and scratch) on the local hard drive of the
initial compute node should fix this problem.
以上转自CCL，其中的NSF应该是NFS的手误。
也就是说，你用了多机并行（不是多核并行），一般多机并行时采用NFS的方式
共享硬盘空间，当你读写其他机器上的文件时，网络出现故障，则显示此类错误。
赞一下(2人) 回复此楼
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
2楼2010-09-04 09:16:24
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heyo_123

至尊木虫 (职业作家)
★ ★ ★
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erylingjet(金币+2):谢谢！ 2010-09-04 10:33:37
http://www.ccl.net/chemistry/res ... .011-dir/index.html


没碰到过，google了一下，看看这个。
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3楼2010-09-04 09:17:02
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erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by zhangmt at 2010-09-04 09:16:24:
Your calculations are failing because of a 'Stale NSF file handle.'
This is common when reading and writing your Gaussian scratch files to
a network drive (NSF mounted) and the NSF server canno ...

谢谢您！是多核并行，4个。在服务器上计算的会有网络问题吗。是不是读写错误呢，之前没出现过这种错误，呵呵。


非常感谢！
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4楼2010-09-04 10:38:25
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coolrainbow

木虫 (著名写手)

未来国家冻凉
★ ★ ★ ★
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erylingjet(金币+3):谢谢，明白了 2010-09-04 12:45:00
Stale file handle可能在诸如这种情况遇到：你的文件在01，然后NFS到06用gaussian计算，这时候01机器挂掉，这个文件消失了，你的计算就停了~~
赞一下(2人) 回复此楼
技术博客：http://hi.baidu.com/coolrainbow/blog
5楼2010-09-04 11:26:49
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