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luuu

金虫 (小有名气)

虫子

[交流] 【求助】求助大牛:怎么能确定某一菌株中是否含有某一基因片段 已有3人参与

求助大牛:怎么能确定某一菌株中是否含有某一基因片段
不晓得怎么样ncbi比对。。。或者其它的妙方
由于刚开始自己做实验,查资料,困难极多。。。真诚希望大牛们帮忙解决,谢谢
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weilin1005

木虫 (正式写手)

副教授

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
karl2100(金币+1):谢谢回帖! 2010-08-31 23:42:30
你要确定什么基因?根据自己需要的基因来设计引物,然后测序,再加上在NCBI上比对,基本上可以搞定。
2楼2010-08-31 14:16:13
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luuu

金虫 (小有名气)

虫子

引用回帖:
Originally posted by weilin1005 at 2010-08-31 14:16:13:
你要确定什么基因?根据自己需要的基因来设计引物,然后测序,再加上在NCBI上比对,基本上可以搞定。

我要寻找的基因已经确定,只是想从NCBI上找找其中几株标准菌株是否含有这个基因。
doing...
3楼2010-09-01 14:15:51
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weilin1005

木虫 (正式写手)

副教授


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by weilin1005 at 2010-08-31 14:16:13:
你要确定什么基因?根据自己需要的基因来设计引物,然后测序,再加上在NCBI上比对,基本上可以搞定。

只要把你的序列输进去,在NCBI上直接比对就可以了。
4楼2010-09-02 20:44:54
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lwh66

金虫 (小有名气)

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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
karl2100(金币+1):多谢指教! 2010-09-03 02:04:58
点NCBI上的BLAST,然后把你的目的基因序列放进去,比较就能得到你要得菌株,还是比较简单的,不过有时BALST有点慢,耐心等等。
5楼2010-09-02 21:18:33
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