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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 药学 » 生物制药 » 【求助】求助大牛：怎么能确定某一菌株中是否含有某一基因片段
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luuu

金虫 (小有名气)

虫子

[交流] 【求助】求助大牛：怎么能确定某一菌株中是否含有某一基因片段 已有3人参与

求助大牛：怎么能确定某一菌株中是否含有某一基因片段
不晓得怎么样ncbi比对。。。或者其它的妙方
由于刚开始自己做实验，查资料，困难极多。。。真诚希望大牛们帮忙解决，谢谢
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doing...
1楼 2010-08-31 09:40:29
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weilin1005

木虫 (正式写手)

副教授
★ ★
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karl2100(金币+1):谢谢回帖！ 2010-08-31 23:42:30
你要确定什么基因？根据自己需要的基因来设计引物，然后测序，再加上在NCBI上比对，基本上可以搞定。
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2楼2010-08-31 14:16:13
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luuu

金虫 (小有名气)

虫子
引用回帖:
Originally posted by weilin1005 at 2010-08-31 14:16:13:
你要确定什么基因？根据自己需要的基因来设计引物，然后测序，再加上在NCBI上比对，基本上可以搞定。

我要寻找的基因已经确定，只是想从NCBI上找找其中几株标准菌株是否含有这个基因。
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doing...
3楼2010-09-01 14:15:51
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weilin1005

木虫 (正式写手)

副教授
★
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引用回帖:
Originally posted by weilin1005 at 2010-08-31 14:16:13:
你要确定什么基因？根据自己需要的基因来设计引物，然后测序，再加上在NCBI上比对，基本上可以搞定。

只要把你的序列输进去，在NCBI上直接比对就可以了。
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4楼2010-09-02 20:44:54
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lwh66

金虫 (小有名气)
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karl2100(金币+1):多谢指教！ 2010-09-03 02:04:58
点NCBI上的BLAST,然后把你的目的基因序列放进去，比较就能得到你要得菌株，还是比较简单的，不过有时BALST有点慢，耐心等等。
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5楼2010-09-02 21:18:33
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