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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 【求助】怎么样才使R值减小点呢？求助
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Nocturne

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】怎么样才使R值减小点呢？求助已有5人参与

我最近收录了一个晶体，空间群已经确定
但是R值仍然很高，
R1 =  0.3393 for    102 Fo > 4sig(Fo)  and  0.5081 for all    324 data
wR2 =  0.5168,  GooF = S =   1.899,  Restrained GooF =    1.899  for all data
我尝试着Omit了一些坏点，但是R1和R1(all data)相差太大，
如下:
Final R indices [I>2sigma(I)]     R1 = 0.0580, wR2 = 0.1008
  
      R indices (all data)              R1 = 0.3322, wR2 = 0.1851
Goodness-of-fit on F^2            0.885
用什么办法使R值减小啊？
在线等，万分感激！
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1楼2010-08-27 22:46:23
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帝夫

至尊木虫 (知名作家)

=一只小小啄木鸟=

优秀版主优秀版主
Nocturne(金币+1): 2010-08-29 19:31:33
wsht212:谢谢交流，希望常来！ 2010-08-30 17:34:12
请正确指认原子，并在ins文件中加入各向异性修正指令！
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万俗皆走圆，一生尤学方！
2楼2010-08-28 08:29:33
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cfocus20

至尊木虫 (职业作家)
★ ★
Nocturne(金币+1): 2010-08-29 19:33:10
帝夫(金币+1):感谢回帖交流！ 2010-08-29 23:01:07
帝夫(金币+1):感谢回帖交流！ 2010-08-29 23:04:03
1. 請確定 space group, crystal system 是否正確
2. 確定分子內所有包含架構是否已完全解析完畢,也包含是否還有溶劑分子
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Smart_work_and_beautiful_life!
3楼2010-08-28 09:18:54
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dengs1017

银虫 (小有名气)
★
Nocturne(金币+1): 2010-08-29 19:33:32
帝夫(金币+1):感谢回帖交流！ 2010-08-29 23:01:48
不断的确认原子，在res文件里面更改权重并保存到ins文件中
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4楼2010-08-28 10:20:49
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Nocturne

木虫 (正式写手)
帝夫:感谢回帖交流！ 2010-08-29 23:02:27
引用回帖:
Originally posted by Nocturne at 2010-08-27 22:46:23:
我最近收录了一个晶体，空间群已经确定
但是R值仍然很高，
R1 =  0.3393 for    102 Fo > 4sig(Fo)  and  0.5081 for all    324 data
wR2 =  0.5168,  GooF = S =   1.899,  Restrained GooF =    1.899  ...

我的化合物很简单就是1,2-环己烷二胺，C6H14N2
空间群应该是对的，谢谢回复
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5楼2010-08-29 19:32:40
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Nocturne

木虫 (正式写手)
帝夫:感谢回帖交流！ 2010-08-29 23:02:24
引用回帖:
Originally posted by cfocus20 at 2010-08-28 09:18:54:
1. 請確定 space group, crystal system 是否正確
2. 確定分子內所有包含架構是否已完全解析完畢,也包含是否還有溶劑分子

你的意思是在.res文件中更改第二个WGHT 数值，还是把此数值copy到ins文件中？
多谢指导
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6楼2010-08-29 19:34:38
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Nocturne

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 帝夫 at 2010-08-28 08:29:33:
请正确指认原子，并在ins文件中加入各向异性修正指令！

谢谢斑竹的金币，呵呵
我以前收录了一个晶体，数据比这个好，空间确定是P21212.
这个晶体的参数和上一个差不多，只是稍微收缩了，我觉得空间群没错，另外我的peak最大为0.38，我觉得可能是数据差的原因。

此外，在lst文件中中的Most disagreebale reflections
发现一些点，在.hkl文件中找不到是什么原因啊？
谢谢！
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7楼2010-08-29 19:44:42
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cfocus20

至尊木虫 (职业作家)
★
帝夫(金币+1):感谢回帖交流！ 2010-08-29 23:04:03
引用回帖:
Originally posted by Nocturne at 2010-08-29 19:34:38:

你的意思是在.res文件中更改第二个WGHT 数值，还是把此数值copy到ins文件中？
多谢指导

將lst檔內的wght 後面這個值copy 至ins檔再進行精修!!
Recommended weighting scheme: WGHT      0.0967      0.0000
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Smart_work_and_beautiful_life!
8楼2010-08-29 22:29:58
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帝夫

至尊木虫 (知名作家)

=一只小小啄木鸟=

优秀版主优秀版主
wsht212:谢谢交流，希望常来！ 2010-08-30 17:34:44
引用回帖:
Originally posted by Nocturne at 2010-08-29 19:44:42:

谢谢斑竹的金币，呵呵
我以前收录了一个晶体，数据比这个好，空间确定是P21212.
这个晶体的参数和上一个差不多，只是稍微收缩了，我觉得空间群没错，另外我的peak最大为0.38，我觉得可能是数据差的原因。

...

你的最大的peak才0.38，是对所有的原子峰说的吗？这不太可能吧！
找到lst里的坏点直接在ins里omit它就行了啊，为啥还要跑到hkl里找他呀？
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万俗皆走圆，一生尤学方！
9楼2010-08-29 23:16:14
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Nocturne

木虫 (正式写手)
★
帝夫(金币+1):感谢回帖交流！ 2010-08-31 01:01:07
引用回帖:
Originally posted by 帝夫 at 2010-08-29 23:16:14:

你的最大的peak才0.38，是对所有的原子峰说的吗？这不太可能吧！
找到lst里的坏点直接在ins里omit它就行了啊，为啥还要跑到hkl里找他呀？

我一开始也是在这样做的，但是最后两个R1值相差太大，总感觉不合适
Qpeak
Fourier peaks appended to .res file

              x       y       z       sof     U      Peak   Distances to nearest atoms (including symmetry equivalents)

Q1    1  -0.8484 -1.3246 -0.6695   1.00000  0.05    0.36   1.67 H1A  1.77 H2A  2.03 H2B  2.16 H1B
Q2    1  -0.3400 -1.1811 -1.0152   1.00000  0.05    0.23   1.01 H3A  1.78 H2A  1.92 C3  2.03 H2B
Q3    1  -0.6583 -1.6572 -0.8250   1.00000  0.05    0.22   1.12 H2A  1.68 H3A  1.69 C2  1.72 H1D
Q4    1  -0.6471 -1.4083 -1.1603   1.00000  0.05    0.19   0.75 H3B  1.65 C3  1.91 H1B  1.99 H2B
Q5    1  -0.4099 -1.1159 -1.1545   1.00000  0.05    0.18   1.43 H3A  1.70 H2A  2.10 H3B  2.11 C3
Q6    1  -0.7579 -1.0704 -0.6967   1.00000  0.05    0.17   1.26 H2B  1.88 H1A  1.96 H1B  1.98 C2
Q7    1  -0.6345 -1.2483 -0.9141   1.00000  0.05    0.17   0.84 C2  0.91 H2B  1.13 C3  1.40 H3B
Q8    1  -0.4160 -1.2073 -0.6663   1.00000  0.05    0.17   0.37 H1D  1.32 C1  2.02 H1A  2.23 C2
Q9    1  -0.8223 -1.5985 -0.7546   1.00000  0.05    0.17   1.27 H2A  1.85 H1B  1.85 H3B  2.18 H1A
Q10   1  -0.8413 -1.3838 -0.4550   1.00000  0.05    0.16   1.14 H1A  1.37 H1D  1.85 N1  2.16 H1A
Q11   1  -0.3720 -1.3816 -0.6587   1.00000  0.05    0.16   1.00 H1D  1.41 C1  1.51 C1  1.66 H2A
Q12   1  -0.4800 -1.1311 -0.4568   1.00000  0.05    0.16   1.42 H1B  1.58 H1D  1.60 N1  1.96 C1
Q13   1  -0.5692 -1.0913 -0.7748   1.00000  0.05    0.15   1.03 H2B  1.39 C2  1.57 H1D  1.73 C1
Q14   1  -0.5000 -1.0000 -0.6404   0.50000  0.05    0.14   1.30 H1D  1.91 C1  2.18 H2B  2.26 N1
Q15   1  -0.7269 -1.5897 -1.0058   1.00000  0.05    0.14   1.55 H2A  1.60 H2B  1.73 H3B  1.79 H3A
Q16   1  -0.6138 -1.1218 -0.4435   1.00000  0.05    0.13   1.10 N1  1.19 H1B  1.33 H1A  2.10 C1
Q17   1  -0.7189 -1.4120 -0.7960   1.00000  0.05    0.13   0.32 H2A  0.89 C2  1.35 H2B  1.90 C1
Q18   1  -0.5999 -1.1949 -0.4459   1.00000  0.05    0.13   0.78 N1  0.83 H1B  1.22 H1A  1.84 C1
Q19   1  -0.6156 -1.2303 -1.2334   1.00000  0.05    0.12   1.27 H3B  1.36 H1B  2.04 N1  2.05 H2A
Q20   1  -0.3308 -1.3756 -1.0181   1.00000  0.05    0.12   1.30 H3A  1.63 H3B  1.76 H2A  1.76 C3
____________________________________________________________
感觉Q1有点大，我看了下
是独立的原子，我觉得Q1可能性不大

[ Last edited by Nocturne on 2010-8-30 at 16:36 ]
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10楼2010-08-30 16:35:25
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