应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】tBuOH作为溶剂，在gaussian中如何输入？
51/1返回列表
查看: 2916  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

chemlilyzhao

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】tBuOH作为溶剂，在gaussian中如何输入？ 已有1人参与

请虫子高手指导：
      
       叔丁醇（tBuOH）做为溶剂，考虑其溶剂化效应，采用Gaussian中IEFPCM模型计算.由于Gaussian软件中没有指定的介电常数，所以不知如何输入，帮忙给出输入的具体格式及其参数，请赐教！


非常感谢！
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

量化

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-08-25 08:43:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

showcat

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
1882418楼: Originally posted by zhangmt at 2010-08-25 21:37:54:
1、自定义溶剂，通常，我不适用dielectric这个字，而是在scrf里面写read，然后在输入文件的最后给出溶剂半径、溶剂密度以及介电常数
2、关于显示的摆放溶剂分子，其实就是在溶质分子周围根据形成氢键的方式明确画 ...

那对于显式溶剂模型来说，如何确定构造的体系是在是在液相中而不是真空气相或者晶体结构呢？因为一般来讲计算分子在气体中的相互作用也是要这样设计初始构型的吧。
赞一下 回复此楼
化工人，初入计算领域
5楼2012-04-18 19:57:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
chemlilyzhao(金币+3):多谢解答！ 2010-08-25 17:24:28
首先呢，g09已经提供了叔丁醇的溶剂，你只需要写明
scrf(iefpcm,solvent=2-Butanol)即可。
其次，如果是g03呢，你只好自定义溶剂了，给你一个数据，叔丁醇的
介电常数=15.944
不过呢，小小的担心一下，考虑一下溶质是否会跟溶剂形成氢键，如果有这个可能，那么用这种隐式的方法计算溶剂效应可能会有很大误差的，最好用显式的方法，摆出溶剂分子——当然，如果没有氢键作用，就无视这句话好了。

[ Last edited by zhangmt on 2010-8-25 at 16:15 ]
赞一下 回复此楼
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
2楼2010-08-25 16:11:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chemlilyzhao

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zhangmt at 2010-08-25 16:11:30:
首先呢，g09已经提供了叔丁醇的溶剂，你只需要写明
scrf(iefpcm,solvent=2-Butanol)即可。
其次，如果是g03呢，你只好自定义溶剂了，给你一个数据，叔丁醇的
介电常数=15.944
不过呢，小小的担心一下，考虑一 ...

我是用gauss03优化的结构，所以想用g03来做溶剂效应来保持一致。后来我又用了关键词scrf=(iefpcm,dielectric=15.9)，还是出错了。是不是我这个关键词用错了呢？

在计算的反应中，溶剂tBuOH 与反应物确实生成了氢键。请问你所说的“最好用显式的方法，摆出溶剂分子” 具体应该怎么做呢？


非常感谢你的解答，thanks！
赞一下 回复此楼
3楼2010-08-25 17:23:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
chemlilyzhao(金币+2):thank you! 2010-08-25 22:46:55
1、自定义溶剂，通常，我不适用dielectric这个字，而是在scrf里面写read，然后在输入文件的最后给出溶剂半径、溶剂密度以及介电常数
2、关于显示的摆放溶剂分子，其实就是在溶质分子周围根据形成氢键的方式明确画出溶剂分子，摆放合适的位置、距离，然后再行计算——因为那种隐式的溶剂化模型都是比较粗糙的，只是把溶剂大环境当成一个背景的电场，小环境也就是被溶质分子占据形成一个空腔，这样的计算，个人感觉多少有点不靠谱。至于怎么摆，那要具体情况具体分析，靠的是经验，我一点不敢乱说，只是看过而已，没有经验。
赞一下(1人) 回复此楼
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
4楼2010-08-25 21:37:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 极限拉扯，如何抉择 +11 Isak0320 2026-10-12 15/750 2026-10-14 21:55 by 猫鱼不是鱼
[基金申请] 申请科研项目纯靠实力能成功吗？ 200+5 David1982 2026-10-13 8/400 2026-10-14 21:38 by lhw_GPA4.0
[硕博家园] 中科院海洋所招收海洋材料相关领域博士研究生及研究助理 +3 sujiner 2026-10-08 4/200 2026-10-14 20:40 by qicaiyun
[职场人生] 40+中年人失业后，还能找到好工作吗？ +3 xqy2009 2026-10-13 3/150 2026-10-14 20:17 by 43358052
[论文投稿] 二审4个多月了还是Awaiting Reviewer Scores 10+3 纳斯达克ML 2026-10-11 4/200 2026-10-14 17:30 by babero
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么？ +4 好运来～9527 2026-10-10 7/350 2026-10-13 08:41 by xli1984
[基金申请] 入职后第一次管课题组的专利缴费，对账才发现官费比别人多掏了一倍 +6 13108017953 2026-10-08 6/300 2026-10-12 20:07 by w3w3y3
[公派出国] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷！
[有机交流] 各位大佬，路线设计求助 +6 zapen 2026-10-08 8/400 2026-10-10 15:59 by zapen
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些？ +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭