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chemlilyzhao金虫 (小有名气)
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[交流]
【求助】tBuOH作为溶剂，在gaussian中如何输入？已有1人参与
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请虫子高手指导： 叔丁醇（tBuOH）做为溶剂，考虑其溶剂化效应，采用Gaussian中IEFPCM模型计算.由于Gaussian软件中没有指定的介电常数，所以不知如何输入，帮忙给出输入的具体格式及其参数，请赐教！ 非常感谢！ |
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5楼2012-04-18 19:57:51
zhangmt
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chemlilyzhao(金币+3):多谢解答！ 2010-08-25 17:24:28
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首先呢，g09已经提供了叔丁醇的溶剂，你只需要写明 scrf(iefpcm,solvent=2-Butanol)即可。 其次，如果是g03呢，你只好自定义溶剂了，给你一个数据，叔丁醇的 介电常数=15.944 不过呢，小小的担心一下，考虑一下溶质是否会跟溶剂形成氢键，如果有这个可能，那么用这种隐式的方法计算溶剂效应可能会有很大误差的，最好用显式的方法，摆出溶剂分子——当然，如果没有氢键作用，就无视这句话好了。 [ Last edited by zhangmt on 2010-8-25 at 16:15 ] |
2楼2010-08-25 16:11:30
chemlilyzhao
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3楼2010-08-25 17:23:45
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chemlilyzhao(金币+2):thank you! 2010-08-25 22:46:55
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1、自定义溶剂，通常，我不适用dielectric这个字，而是在scrf里面写read，然后在输入文件的最后给出溶剂半径、溶剂密度以及介电常数 2、关于显示的摆放溶剂分子，其实就是在溶质分子周围根据形成氢键的方式明确画出溶剂分子，摆放合适的位置、距离，然后再行计算——因为那种隐式的溶剂化模型都是比较粗糙的，只是把溶剂大环境当成一个背景的电场，小环境也就是被溶质分子占据形成一个空腔，这样的计算，个人感觉多少有点不靠谱。至于怎么摆，那要具体情况具体分析，靠的是经验，我一点不敢乱说，只是看过而已，没有经验。 |
4楼2010-08-25 21:37:54