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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】求金属离子的参数
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donglh

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】求金属离子的参数

谁知道六配位的Mn(2+)或Mg(2+)的参数，在各力场参数文件中的都是游离态离子的，哪位大侠知道告诉我网址或相关的文献也行，谢了
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1楼 2010-08-20 18:28:25
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tingjun

木虫 (小有名气)
★
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-09-06 10:38:09
请问是不是Mn2+和Ma2+的可以混用啊
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3楼2010-09-06 10:34:42
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tingjun

木虫 (小有名气)
★ ★
donglh(金币+2):谢谢参与
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-09-06 10:38:04
http://www.pharmacy.manchester.ac.uk/bryce/amber
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2楼2010-09-06 10:33:35
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donglh

银虫 (小有名气)

参数

二楼给的给的网址里是AMBER立场中游离金属离子的参数呀
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4楼2010-09-08 12:39:05
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gzgzgz

铜虫 (小有名气)
★
donglh(金币+2):谢谢参与
我做的叶绿素，其中的Mg其实是5配位的，但力场拟合的是4配位的，还有一个HIS用非键力算了。不同的原子配位电荷都不一样的，可能得去找整个分子。
引用回帖:
Originally posted by donglh at 2010-08-20 18:28:25:
谁知道六配位的Mn(2+)或Mg(2+)的参数，在各力场参数文件中的都是游离态离子的，哪位大侠知道告诉我网址或相关的文献也行，谢了

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5楼2010-09-28 04:58:45
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