| 查看: 1378 | 回复: 5 | |||
kehan_1230铜虫 (小有名气)
|
[交流]
【求助】有关packmol的问题 已有4人参与
|
|
前段时间没怎么用packmol，现在发现突然不行了，错误如下： Packmol must be run with: packmol < inputfile.inp Userguide at: www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol Reading input file... (Control-C aborts) Seed for random number generator: 19128787 Output file: mixture.pdb Reading coordinate file: water.pdb ERROR: Failed to read coordinates from file: water.pdb Probably the coordinates are not in standard PDB file format. Standard PDB format specifications can be found at: www.rcsb.org/pdb STOP 0 需要指出的是： （1）我编译packmol是成功的； （2）执行时命令也没错； （3）我用的是官网上下的例子； 可是还是出现上述问题，我以前用时步骤和现在一样，但没有问题，不知道为什么现在会这样？ 前段时间实验室有同学也出现过上述问题，但没弄明白原因…… 请高手指点…… |
回复此楼» 猜你喜欢
所感
已经有3人回复
-
要不要辞职读博？
已经有7人回复
-
不自信的我
已经有11人回复
-
北核录用
已经有3人回复
-
实验室接单子
已经有3人回复
-
磺酰氟产物，毕不了业了！
已经有8人回复
-
求助:我三月中下旬出站，青基依托单位怎么办？
已经有10人回复
-
26申博（荧光探针方向，有机合成）
已经有4人回复
-
论文终于录用啦！满足毕业条件了
已经有26人回复
-
2026年机械制造与材料应用国际会议 （ICMMMA 2026）
已经有4人回复
043114076
木虫 (正式写手)
- 应助: 49 (小学生)
- 金币: 3364.9
- 散金: 52
- 红花: 23
- 帖子: 788
- 在线: 369.5小时
- 虫号: 570592
- 注册: 2008-06-07
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
2楼2010-08-18 22:13:42
kehan_1230
铜虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 110.5
- 散金: 143
- 红花: 2
- 帖子: 289
- 在线: 66.5小时
- 虫号: 839624
- 注册: 2009-09-03
- 专业: 高分子物理与高分子物理化
3楼2010-08-19 12:55:06
043114076
木虫 (正式写手)
- 应助: 49 (小学生)
- 金币: 3364.9
- 散金: 52
- 红花: 23
- 帖子: 788
- 在线: 369.5小时
- 虫号: 570592
- 注册: 2008-06-07
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
4楼2010-08-19 13:25:42
budgerigar
木虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 4027.6
- 红花: 1
- 帖子: 114
- 在线: 73.1小时
- 虫号: 554984
- 注册: 2008-05-08
- 专业: 理论和计算化学
5楼2011-12-22 08:23:25
6楼2022-09-26 23:27:26