24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 3910  |  回复: 14

lifei_dut

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】请教大家DS 2.5对接结果分析

请教大家,采用DS 2.5 进行分子对接之后,想要分析受体-配体之间的相互作用。结果文件中有如下几项,molecule.sd, charmm logs.zip,还有个view results。应该如何操作可以得到受体-配体间的相互作用图呢?
我尝试着做,但是分别出现了如下的错误:




恳请明白的大侠帮忙,给出个详细的分析步骤,十分感谢。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

Discovery Studio 常见问题及使用教程

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hekai16

木虫 (正式写手)

★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-08-17 16:10:44
对你的第一个问题,很显然是没有选中你想要显示的项目,应该选中后再点击要查看的配体和受体相互作用情况
2楼2010-08-17 14:33:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

CADD

银虫 (正式写手)


ghcacj(金币+1):谢谢 2010-08-22 21:11:15
lifei_dut(金币+1):我转了,不过还是谢谢你。 2010-08-23 08:24:56
你的小分子在对接前是不是没有转换成三维结构呀?
3楼2010-08-22 17:49:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

CADD

银虫 (正式写手)


lifei_dut(金币+1): 2010-08-24 08:47:25
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-08-24 13:06:34
你用的是那种对接模式呀?libdock,ligandfit,还是CDOCKER?
4楼2010-08-24 08:29:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lifei_dut

金虫 (小有名气)

我用的CDOCKER
5楼2010-08-24 08:47:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tingjun

木虫 (小有名气)


ghcacj(金币+1):谢谢 2010-08-24 13:06:28
点击ViewResults然后选中配体,就可以显示相互作用图了
6楼2010-08-24 09:23:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chongchong11

至尊木虫 (著名写手)

Senior Engineer

云里雾里的。
Nature+Science=Wisdom
7楼2010-08-24 17:58:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wdali

金虫 (正式写手)


ghcacj(金币+1):谢谢 2010-09-07 09:47:44
查看相互作用图前,选中配体看看。
统治这个世界的是想象力
8楼2010-09-07 09:09:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chemozhang

木虫 (正式写手)

帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《Discovery Studio 常见问题及使用教程
故地如重游月圆更寂寞
9楼2011-09-05 20:15:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yinwzi

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主是要做2D的相互作用图吗?
10楼2013-02-27 15:51:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lifei_dut 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿0703化学招61最终排名62化学求调剂 +28 招61排名62 2026-04-07 32/1600 2026-04-13 09:50 by Faiz5552
[考研] 266调剂 +9 daya sun 2026-04-07 10/500 2026-04-13 09:35 by 紫曦紫棋
[考研] 一志愿211 0703化学 346分求调剂 +23 土豆er? 2026-04-09 24/1200 2026-04-13 09:23 by lhj2009
[考研] 生物学调剂,一志愿西南大学348,Top期刊一区二作、二区三作,三等奖学金三次 +5 candyyyi 2026-04-09 5/250 2026-04-13 09:02 by 可淡不可忘
[考研] 0854调剂 +10 长弓傲 2026-04-12 12/600 2026-04-13 08:49 by Sammy2
[考研] 085410 273求调剂 +10 X1999 2026-04-09 10/500 2026-04-12 09:24 by 逆水乘风
[考研] 290求调剂 +13 luoziheng 2026-04-10 13/650 2026-04-11 23:15 by labixiaoqiao
[考研] 22408 352分求调剂0854类 +4 努力的夏末 2026-04-09 4/200 2026-04-11 09:57 by zhq0425
[考研] 本科西工大 324求调剂 +4 wysyjs25 2026-04-10 4/200 2026-04-10 20:00 by 来看流星雨10
[考研] 266求调剂 +29 阳阳哇塞 2026-04-07 29/1450 2026-04-10 16:20 by 高维春
[考研] 一志愿华东师范生物学326分,求调剂 +8 刘墨墨 2026-04-09 8/400 2026-04-10 12:00 by pengliang8036
[考研] 环境专硕调剂 +16 会说话的肘子 2026-04-06 16/800 2026-04-10 10:30 by asy1wn
[考研] 347材料专硕求调剂 +19 zj8215216 2026-04-06 19/950 2026-04-10 09:36 by 690616278
[考研] 0703化学求调剂 +21 不知名的小卅 2026-04-08 21/1050 2026-04-09 18:55 by l_paradox
[考研] 332,085601求调剂 +12 ydfyh 2026-04-09 14/700 2026-04-09 17:28 by wp06
[论文投稿] 求助文献原文 10+3 18500821399 2026-04-08 3/150 2026-04-09 16:56 by 北京莱茵润色
[考研] 求调剂,现在还能填的 +3 上岸小莹加油 2026-04-08 3/150 2026-04-08 14:30 by zhq0425
[考研] 388求调剂 +6 四川王涛 2026-04-07 8/400 2026-04-08 00:17 by JourneyLucky
[考研] 生物医药调剂|SCI中科院三区一作+多项科研成果 +8 likangxing 2026-04-07 11/550 2026-04-08 00:02 by lys0704
[考研] 材料调剂 +17 小刘同学吖吖 2026-04-06 18/900 2026-04-07 11:41 by 诗与自由
信息提示
请填处理意见