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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】请教大家DS 2.5对接结果分析
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lifei_dut

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】请教大家DS 2.5对接结果分析

请教大家，采用DS 2.5 进行分子对接之后，想要分析受体-配体之间的相互作用。结果文件中有如下几项，molecule.sd, charmm logs.zip，还有个view results。应该如何操作可以得到受体-配体间的相互作用图呢？
我尝试着做，但是分别出现了如下的错误：




恳请明白的大侠帮忙，给出个详细的分析步骤，十分感谢。
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1楼 2010-08-17 09:58:46
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xxy9527

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
2475427楼: Originally posted by yinwzi at 2013-02-27 15:51:27
楼主是要做2D的相互作用图吗？

libdock的2D图需要怎么操作才会显示，使用DS2.5的，只能看到配体结构而看不到相互作用的。
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11楼2013-04-02 17:07:06
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hekai16

木虫 (正式写手)
★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-08-17 16:10:44
对你的第一个问题，很显然是没有选中你想要显示的项目，应该选中后再点击要查看的配体和受体相互作用情况
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2楼2010-08-17 14:33:15
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CADD

银虫 (正式写手)
★
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-08-22 21:11:15
lifei_dut(金币+1):我转了，不过还是谢谢你。 2010-08-23 08:24:56
你的小分子在对接前是不是没有转换成三维结构呀？
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3楼2010-08-22 17:49:28
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CADD

银虫 (正式写手)
★
lifei_dut(金币+1): 2010-08-24 08:47:25
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-08-24 13:06:34
你用的是那种对接模式呀？libdock，ligandfit，还是CDOCKER？
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4楼2010-08-24 08:29:53
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