应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】侯老师的vasp入门的晶格优化部分没看懂，问一下
262/3返回列表上一页123下一页
查看: 10016  |  回复: 25
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

fzuvivi

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by magiczerg at 2010-08-14 20:14:33:
复杂的情况,以六角结构Mg的晶格常数为例
1.先进行一次体积保持不变的粒子驰豫的计算（ISIF=5）
2再把优化得到的CONTCAR拷贝成POSCAR，进行一次静态的计算
3对a的值取10个左右的点，每个点重复上面两步，得到静 ...

楼主，看了侯老师的指南，对于简单六方结构的弛豫，我也存在着同样的疑惑。想必楼主的疑惑应该得到解决了吧。。

能不能也帮我指导指导。 ~~~~~不胜感激！
赞一下 回复此楼
11楼2011-04-01 10:07:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lrjhxh

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
怎样设置让不同的a值的情况下保持平衡体积不变？
赞一下 回复此楼
12楼2012-03-17 19:26:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

刘小伟110

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by valenhou001 at 2010-08-16 18:11:45
弄这个run_cell的东西，主要是为了得到E-V曲线，然后通过状态方程拟合得到平衡体积和体弹性模量。如果你只想得到平衡体积以及相应的晶格常数和原子位置，直接ISIF=3做fully optimization就可以了。...

valenhou001您好，我是个vasp新手，想问一下，我想计算单独气态分子的振动频率，我该怎么设置INCAR 呢，而且好像频率有很多，怎么找到振动频率呢
赞一下 回复此楼
慢慢的思考。。。
13楼2013-12-26 22:22:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

valenhou001

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
13楼: Originally posted by 刘小伟110 at 2013-12-26 23:22:21
valenhou001您好，我是个vasp新手，想问一下，我想计算单独气态分子的振动频率，我该怎么设置INCAR 呢，而且好像频率有很多，怎么找到振动频率呢...

vasp只能算振动频率，其他的比如平动和转动频率不能计算。

计算频率的方法有两种，一种是直接的，基于finite dispacement，另外一种是基于密度泛函微扰论(或线性响应的方法)。
对于第一种很简单。看一下手册的这里就可以：http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp/vasp/IBRION_5_IBRION_6.html
赞一下 回复此楼
14楼2013-12-27 09:36:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

刘小伟110

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
14楼: Originally posted by valenhou001 at 2013-12-27 09:36:02
vasp只能算振动频率，其他的比如平动和转动频率不能计算。

计算频率的方法有两种，一种是直接的，基于finite dispacement，另外一种是基于密度泛函微扰论(或线性响应的方法)。
对于第一种很简单。看一下手册的 ...

valenhou001您好,首先谢谢您的帮助，我按您所说的，计算了H2O的频率，而我的目的是计算零点能校正。
（1）图中这9个频率应该都算是振动频率吧，对于单个分子计算的话，为什么会出现f/i呢，而且还这么大？怎么把它消除呢？
（2）还有一个问题就是我要做零点能校正的话，按E=1/2hv公式，把所有频率的能量相加，大约就是0.7eV，按理说，零点能校正的话，不会是这么大的值，也就是0.02eV，是不是这中计算方法有误呢？
（3）我如果要对气态分子吸附态进行零点能校正的话，比如H2O在Cu上的吸附，要计算频率，我是不是应该把H2O和Cu的第一层原子弛豫，把所有的频率的能量相加，就算是零点能呢？是不是应该把Cu原子弛豫的频率去掉，只加H2O的频率呢，但是那样的话，我根本就不能从所有的频率中区分H2O和Cu的频率啊？
最近甚是苦恼啊，还望您能指点迷津，期待您的回复，在此，万分感谢。。。
【求助】侯老师的vasp入门的晶格优化部分没看懂，问一下
3.3.jpg
赞一下(1人) 回复此楼
慢慢的思考。。。
15楼2014-01-01 21:02:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

葵cc_

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by valenhou001 at 2010-08-16 18:11:45
弄这个run_cell的东西，主要是为了得到E-V曲线，然后通过状态方程拟合得到平衡体积和体弹性模量。如果你只想得到平衡体积以及相应的晶格常数和原子位置，直接ISIF=3做fully optimization就可以了。...

侯老师，请问我想做表面材料的结构优化，已经确定好了encut，k-mesh大小和SIGMA的值，接下来是应该直接根据楼主说的这种顺序进行呢？还是只优化原子位置，不用优化晶格常数？还是具体应该怎做？
赞一下 回复此楼
16楼2014-04-03 14:28:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Brilliantly

捐助贵宾 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by valenhou001 at 2010-08-16 18:11:45
弄这个run_cell的东西，主要是为了得到E-V曲线，然后通过状态方程拟合得到平衡体积和体弹性模量。如果你只想得到平衡体积以及相应的晶格常数和原子位置，直接ISIF=3做fully optimization就可以了。...

请问一下怎么运行run-cell文件啊？需要linux的什么命令啊？
赞一下 回复此楼
加油！
17楼2014-05-06 20:50:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Brilliantly

捐助贵宾 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问怎么运行run-cell？用linux的什么命令啊？
赞一下 回复此楼
加油！
18楼2014-05-06 20:52:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

magicmonk

至尊木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by valenhou001 at 2010-08-16 18:11:45
弄这个run_cell的东西，主要是为了得到E-V曲线，然后通过状态方程拟合得到平衡体积和体弹性模量。如果你只想得到平衡体积以及相应的晶格常数和原子位置，直接ISIF=3做fully optimization就可以了。...

请问ISIF=做完fully optimization，后续的电子结构计算需要改ISIF吗？
赞一下 回复此楼
我们最深的恐惧不是我们能力不够，我们最深的恐惧是能力超越了极限。
19楼2014-06-24 19:16:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

valenhou001

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
19楼: Originally posted by magicmonk at 2014-06-24 20:16:28
请问ISIF=做完fully optimization，后续的电子结构计算需要改ISIF吗？...

最好改掉. 或者将NSW设置为0.
赞一下 回复此楼
20楼2014-06-24 19:44:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 magiczerg 的主题更新
262/3返回列表上一页123下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +3 oepdf5z972 2026-06-20 3/150 2026-06-21 21:01 by zo4669e5n4
[基金申请] E0414, 我的本子有没有希望？ +7 布布和一二 2026-06-17 9/450 2026-06-21 19:29 by 布布和一二
[教师之家] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +3 9skg9htng1 2026-06-20 3/150 2026-06-21 18:58 by q1p9ixelzp
[公派出国] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +3 9skg9htng1 2026-06-20 3/150 2026-06-21 18:00 by q1p9ixelzp
[考研] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +3 9skg9htng1 2026-06-20 4/200 2026-06-21 17:45 by q1p9ixelzp
[论文投稿] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +3 9skg9htng1 2026-06-20 3/150 2026-06-21 17:40 by q1p9ixelzp
[论文投稿] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +3 9skg9htng1 2026-06-20 3/150 2026-06-21 17:37 by q1p9ixelzp
[公派出国] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +4 vlfdw50o0u 2026-06-20 4/200 2026-06-21 17:25 by ky8v3skvft
[考博] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +4 vlfdw50o0u 2026-06-20 5/250 2026-06-21 17:20 by ky8v3skvft
[博后之家] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +4 vlfdw50o0u 2026-06-20 6/300 2026-06-21 17:05 by ky8v3skvft
[公派出国] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +4 vlfdw50o0u 2026-06-20 5/250 2026-06-21 17:00 by ky8v3skvft
[教师之家] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +5 vlfdw50o0u 2026-06-20 7/350 2026-06-21 16:57 by ky8v3skvft
[论文投稿] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +3 vlfdw50o0u 2026-06-20 5/250 2026-06-21 16:45 by ky8v3skvft
[论文投稿] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +4 vlfdw50o0u 2026-06-20 9/450 2026-06-21 16:37 by ky8v3skvft
[基金申请] 青A35岁以下通知答辩了吗 +3 暨阳一只柴 2026-06-17 3/150 2026-06-21 09:39 by kudofaye
[考博] 【全奖博士/科研助理/博后招生】新加坡南洋理工大学机械与航空航天学院 +3 robohaha 2026-06-15 4/200 2026-06-21 00:36 by lanbing1
[硕博家园] 一篇论文同时出现在两个期刊，一模一样，这算不算学术不端，请各位老师斧正。 +11 mahl005 2026-06-14 12/600 2026-06-18 17:01 by 770904134
[基金申请] 希望面上有个好结果 +7 碧水00 2026-06-16 7/350 2026-06-18 12:18 by wuke100666
[论文投稿] 三区计算机方向期刊推荐 +5 1457340941 2026-06-15 5/250 2026-06-17 13:16 by 会议编辑
[论文投稿] sci论文二审求助 +5 潘倍倍 2026-06-15 5/250 2026-06-16 10:15 by xs74101122
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭