应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】并行错误？
91/1返回列表
查看: 1031  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

huangyc

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】并行错误？

大家好
我的任务提交后，一个离子步下来出现如下错误：
1 F= -.25714837E+03 E0= -.25714532E+03  d E =-.257148E+03
rank 1 in job 1  localhost.localdomain_43175   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 1: killed by signal 11
rank 0 in job 1  localhost.localdomain_43175   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 0: killed by signal 9
google了一下，我没能解决。自己这方面水平不高，特请教版内各位如何解决，谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-08-14 18:35:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lono75

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
zzy870720z(金币+2):谢谢提示 2010-08-14 21:39:14
huangyc(金币+3):xiexie 2010-08-15 09:15:42
检查一下你的
1)MPI
2)fft3d
是否编译及设置正确
赞一下(1人) 回复此楼
由天命,成人事！
2楼2010-08-14 18:45:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huangyc

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by lono75 at 2010-08-14 18:45:15:
检查一下你的
1)MPI
2)fft3d
是否编译及设置正确

这个机器我一直没动过，前几天还能用，MPI和fft3d以及编译、环境等我都未动(如何检查？)，而且调用别人的vasp也不行，而别人的帐号则可以正常使用
我新增一个用户，错误依旧

祝福舟曲！
赞一下 回复此楼
3楼2010-08-15 09:15:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gleerat

木虫 (正式写手)
huangyc(金币+3):xiexie 2010-08-16 14:20:46
引用回帖:
Originally posted by huangyc at 2010-08-15 09:15:09:


这个机器我一直没动过，前几天还能用，MPI和fft3d以及编译、环境等我都未动(如何检查？)，而且调用别人的vasp也不行，而别人的帐号则可以正常使用
我新增一个用户，错误依旧

祝福舟曲！

我以前也遇到过类似的问题，我们集群上的VASP我一直没动，之前别人用的时候没听说有什么毛病，到我的时候就出错了，后来有网友说是数学库、环境变量估计丢失了，我自己又重新设置了一次就好了。你可以试试，你的可执行文件应该没问题。
赞一下 回复此楼
明察、慎思、笃行
4楼2010-08-15 10:49:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lono75

铁杆木虫 (著名写手)
★
zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2010-08-15 12:50:36
huangyc(金币+2):再谢 2010-08-16 14:22:29
引用回帖:
Originally posted by huangyc at 2010-08-15 09:15:09:


这个机器我一直没动过，前几天还能用，MPI和fft3d以及编译、环境等我都未动(如何检查？)，而且调用别人的vasp也不行，而别人的帐号则可以正常使用
我新增一个用户，错误依旧

祝福舟曲！

复制别的用户下的
/home/other usrname/.bashrc and .bash_profile
到你的用户名下
/home/your usrname
赞一下(1人) 回复此楼
由天命,成人事！
5楼2010-08-15 11:04:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huangyc

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by gleerat at 2010-08-15 10:49:57:

我以前也遇到过类似的问题，我们集群上的VASP我一直没动，之前别人用的时候没听说有什么毛病，到我的时候就出错了，后来有网友说是数学库、环境变量估计丢失了，我自己又重新设置了一次就好了。你可以试试，你的 ...

你讲的重新设置是什么意思？环境变量即是bashrc,bash_profile吧，数学库呢，不是在编译的时候指定了嘛，如何重新设置？

谢谢
赞一下 回复此楼
6楼2010-08-16 14:22:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huangyc

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by lono75 at 2010-08-15 11:04:09:

复制别的用户下的
/home/other usrname/.bashrc and .bash_profile
到你的用户名下
/home/your usrname

我试过了，还是不行。很怪，我是root用户交的作业，新增一个也不行，错误依旧
赞一下 回复此楼
7楼2010-08-16 14:23:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gleerat

木虫 (正式写手)
★
zzy870720z(金币+1):谢谢交流 2010-08-16 17:27:18
huangyc(金币+2): 2010-08-17 10:28:35
引用回帖:
Originally posted by huangyc at 2010-08-16 14:22:12:


你讲的重新设置是什么意思？环境变量即是bashrc,bash_profile吧，数学库呢，不是在编译的时候指定了嘛，如何重新设置？

谢谢

是数学库和并行库的环境变量。我安装的时候是新建ld.so.conf文件的，没有设置.bashrc。你应该看看或者试试更新这两个文件中的一个。
不过，在我印象中，.bashrc好像应该是root账户下的。不知道对低权限账户的影响如何。

[ Last edited by gleerat on 2010-8-16 at 15:24 ]
赞一下(1人) 回复此楼
明察、慎思、笃行
8楼2010-08-16 15:23:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huangyc

木虫 (正式写手)
网上看到一些类似错误的原因，除正常可以想象的原因（如上述各位所说），也有是无法理解的，比如我这个
我把NSW改小或者改变IBRION即可正常并行
各位若有知道可以的原因，请告诉大家，谢过
赞一下 回复此楼
9楼2010-08-17 10:28:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 huangyc 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 26申博 +3 八旬速览 2026-03-16 3/150 2026-03-17 11:40 by nxgogo
[考研] 289求调剂 +6 步川酷紫123 2026-03-11 6/300 2026-03-17 10:23 by Sammy2
[考研] 293求调剂 +5 世界首富 2026-03-11 5/250 2026-03-17 10:16 by Sammy2
[考研] 283求调剂 +3 听风就是雨； 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:41 by 热情沙漠
[考研] 333求调剂 +3 文思客 2026-03-16 7/350 2026-03-16 18:21 by 文思客
[考研] 梁成伟老师课题组欢迎你的加入 +8 一鸭鸭哟 2026-03-14 9/450 2026-03-16 17:35 by 沐霖12138
[考研] 304求调剂 +4 ahbd 2026-03-14 4/200 2026-03-16 16:48 by 我的船我的海
[考研] 材料与化工专硕调剂 +3 heming3743 2026-03-16 3/150 2026-03-16 15:05 by peike
[考研] 一志愿华中师范071000，325求调剂 +6 RuitingC 2026-03-12 6/300 2026-03-16 14:50 by 可淡不可忘
[考研] 309求调剂 +5 花与叶@ 2026-03-10 5/250 2026-03-16 14:13 by 哦哦123
[考研] 326求调剂 +4 上岸的小葡 2026-03-15 5/250 2026-03-16 08:39 by Linda Hu
[考研] 复试调剂 +3 呼呼？~+123456 2026-03-14 3/150 2026-03-14 16:53 by WTUChen
[考研] 材料与化工（0856）304求B区调剂 +6 邱gl 2026-03-12 7/350 2026-03-13 23:24 by 邱gl
[考研] 279求调剂 +3 Dizzy123@ 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:02 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西南交大，材料专硕317求调剂 +5 lx8568 2026-03-11 5/250 2026-03-13 21:43 by peike
[考研] 0817化学工程与技术考研312分调剂 +3 T123 tt 2026-03-12 3/150 2026-03-13 10:49 by houyaoxu
[考研] 化工学硕306求调剂 +9 42838695 2026-03-12 9/450 2026-03-13 10:16 by houyaoxu
[考研] 283求调剂，材料、化工皆可 +8 苏打水7777 2026-03-11 10/500 2026-03-13 09:06 by Linda Hu
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-03-12 4/200 2026-03-12 19:33 by 求调剂zz
[考研] 279求调剂 +3 莫xiao 2026-03-10 4/200 2026-03-11 08:06 by 斩魂滴兔子！
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭