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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 基因组学相关软件列表
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amier1

[交流] 基因组学相关软件列表

1、基因组组装分析：phred, phd2fasta, phrap, consed, arachne, RePS

　　2、功能注释：glimmer, genewise, genscan, fgenesh, BGF, tRNAscan-SE, MicroRNA, sim4, InterproScan, GO, WEGO, Promoter 2.0, Disembl

　　3、重复序列：Repeatmasker, ReAS

　　4、比较基因组：cross_match, blastall, blastz, blat, Fasta, CAT, MUMmer, smith-waterman

　　5、表达(EST、芯片、蛋白)：cap3, BGI-EST analysis package, BGI-Array analysis package, BGI-Proteomics analysis package

　　6、分子进化：K-Estimator, codeml, yn00, clustalw

　　7、多态性：primer3, SNPdetector, polyphred, BGI-Variation analysis package
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1楼 2006-04-13 12:57:15
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tigeryth

金虫 (小有名气)

1

好东西！谢谢收集整理！！
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4楼2006-04-14 20:46:38
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pzr365

1

兄弟什么时候可以下载呀？
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2楼2006-04-13 13:09:39
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jinhx87

至尊木虫 (知名作家)

0.5

请问在何处能下哉？
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3楼2006-04-14 06:36:31
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amier1

这些软件多时linux下工作的，可以免费获取
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6楼2006-04-16 20:46:55
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