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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

[交流] 【讨论】全酶or单亚基?

在这里讨论一下一个和师兄有分歧的问题:
分子动力学模拟需不需要包括酶的全部亚基
问题的背景在于:一个酶里有多个功能不同的亚基,其中只有一个负责底物结合的,另外的亚基负责电子传递。在这里,我和师兄产生了分歧:
我认为因为只有一个亚基涉及底物结合,那么计算FEP时只需要应用这个亚基作为反应体系来考虑即可,而师兄认为需要用全酶。
请各位虫友讨论一下那种说法比较合理?
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