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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 【求助/交流】请问，有没有谁知道，如何从NCBI上批量下载一类gene的核苷酸序列？
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！

[交流] 【求助/交流】请问，有没有谁知道，如何从NCBI上批量下载一类gene的核苷酸序列？ 已有7人参与

如题，我在NCBI上面搜索一个gene，得到一千多个结果，我想把这些结果的序列下载下来，可是，有些序列的ID号里面是基因组的ID号，就是说，我下载下来的是基因组序列，而我只想要里面相应基因的序列，NCBI里面搜索结果里，有对相关基因的定位，说是从哪个位点到哪个位点，有什么软件可以达到我的要求呢！

请了解相关知识的高手解答下，不胜感激！
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1楼 2010-07-20 11:51:39
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shiliu2011

木虫 (正式写手)
★
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引用回帖:
12楼: Originally posted by xp198766 at 2011-12-07 23:11:14:
可以在NCBI的gene里面搜索感兴趣的东西，就可以得到相应的GENEID了。。

您好，是这样的。我用自己测得的16srRNA序列在ncbi里比对，比对上的有些结果的ID是整个基因组的ID，而我的序列比对上的部分实际上只是其中的16S的序列，那么我怎样得到这个基因组中16s序列的ID呢？请你指教！万分感谢！
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鎴戜滑鎬绘槸澶繃浜庡湪涔庝竴鏃剁殑寰楀け锛屽?村繕璁颁簡鎴?闀挎�?鏄渶閲?瑕?鐨�
13楼2011-12-08 10:00:08
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hihoney

铁杆木虫 (职业作家)
★
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Are you mad?

做蓝藻分类也不需要这样啊。
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2楼2010-07-20 14:05:42
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
引用回帖:
Originally posted by hihoney at 2010-07-20 14:05:42:
Are you mad?

做蓝藻分类也不需要这样啊。

最近老板想让我做些生物信息学的东西，关于蓝藻的……我知道NCBI上面有个工具，NCBI eUtils，但是我现在还没有弄懂，希望 高手予以解答！
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3楼2010-07-20 16:48:29
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姜大磊

木虫 (小有名气)
★
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引用回帖:
Originally posted by xp198766 at 2010-07-20 11:51:39:
如题，我在NCBI上面搜索一个gene，得到一千多个结果，我想把这些结果的序列下载下来，可是，有些序列的ID号里面是基因组的ID号，就是说，我下载下来的是基因组序列，而我只想要里面相应基因的序列，NCBI里面搜索结 ...

非常感谢楼主这么有价值的问题。 偶也想借助宝地顺便问一下怎么样使用NCBI查找已经明确的基因序列啊？谢谢！
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Nevergiveup,neverslowdown;Nevergrowold,nevereverdieyoung......
4楼2010-07-20 20:28:27
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