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bs340248

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】如何固定碳管中碳原子坐标在模拟中不变已有2人参与

大家好,
在模拟碳管和里面金属的时候,我想把碳管固定,但是使用fix 1 cnt rigid single后发现,
1、碳管中C-C作用力仍然计算了,耗时很大
2、碳管作为一个整体在运动
这都不是我想要的,如何做才能将碳管中的原子定住不动?能够做到,
1、不再计算C-C之间的作用力
2、碳管上每个C原子的坐标在整个模拟过程中不变
谢谢
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xunbao15

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
bs340248(金币+1): 2010-07-15 09:03:07
ghcacj(金币+3):谢谢 2010-07-15 10:27:45
bs340248(金币+1): 2010-08-03 14:26:39
初始速度设为0后,不对碳管部分进行时间积分即可,也就是NVT,NVE,NPT等系综只作用在其他部分。不过这样的话,相当于没有这个碳管,这也许不是你想要的。你是想C-C不作用,C-金属可以作用的话,你可以用neigh_modify exclude 命令把C-C作用力取消,还有一些其他方法,你看看手册的这个命令就明白了。
2楼2010-07-14 23:46:45
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bs340248

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by xunbao15 at 2010-07-14 23:46:45:
初始速度设为0后,不对碳管部分进行时间积分即可,也就是NVT,NVE,NPT等系综只作用在其他部分。不过这样的话,相当于没有这个碳管,这也许不是你想要的。你是想C-C不作用,C-金属可以作用的话,你可以用neigh_mo ...

谢谢,我尝试一下
3楼2010-07-15 09:03:31
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FSW大哥

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
fix setforce 0.0 0.0 0.0
4楼2018-11-28 09:56:34
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