24小时热门版块排行榜    

查看: 1096  |  回复: 3

bs340248

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】如何固定碳管中碳原子坐标在模拟中不变 已有2人参与

大家好,
在模拟碳管和里面金属的时候,我想把碳管固定,但是使用fix 1 cnt rigid single后发现,
1、碳管中C-C作用力仍然计算了,耗时很大
2、碳管作为一个整体在运动
这都不是我想要的,如何做才能将碳管中的原子定住不动?能够做到,
1、不再计算C-C之间的作用力
2、碳管上每个C原子的坐标在整个模拟过程中不变
谢谢
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xunbao15

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
bs340248(金币+1): 2010-07-15 09:03:07
ghcacj(金币+3):谢谢 2010-07-15 10:27:45
bs340248(金币+1): 2010-08-03 14:26:39
初始速度设为0后,不对碳管部分进行时间积分即可,也就是NVT,NVE,NPT等系综只作用在其他部分。不过这样的话,相当于没有这个碳管,这也许不是你想要的。你是想C-C不作用,C-金属可以作用的话,你可以用neigh_modify exclude 命令把C-C作用力取消,还有一些其他方法,你看看手册的这个命令就明白了。
2楼2010-07-14 23:46:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bs340248

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by xunbao15 at 2010-07-14 23:46:45:
初始速度设为0后,不对碳管部分进行时间积分即可,也就是NVT,NVE,NPT等系综只作用在其他部分。不过这样的话,相当于没有这个碳管,这也许不是你想要的。你是想C-C不作用,C-金属可以作用的话,你可以用neigh_mo ...

谢谢,我尝试一下
3楼2010-07-15 09:03:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

FSW大哥

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
fix setforce 0.0 0.0 0.0
4楼2018-11-28 09:56:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 bs340248 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 科研孤儿太难了 +14 我4大白菜 2026-08-20 15/750 2026-08-20 22:33 by 袁向阳007
[基金申请] 时间戳又变了 +12 wuchongjun 2026-08-20 17/850 2026-08-20 20:05 by spzhao
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +21 yaoyewhu2008 2026-08-20 22/1100 2026-08-20 17:03 by yaoyewhu2008
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+3 snowwithsea 2026-08-19 12/600 2026-08-20 15:56 by lfy8008
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +14 kkkl_v 2026-08-19 15/750 2026-08-20 08:21 by sunzitan
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] 2027广东省杰青 +4 奶牛小黑 2026-08-15 10/500 2026-08-19 11:02 by wanfengnew
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +6 Tide man 2026-08-14 7/350 2026-08-19 09:56 by ZJTJZ
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
信息提示
请填处理意见