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木子米米

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】药效团特征选择 已有1人参与

在DS里用HipHop计算活性最强的六个分子,选择特征为HBA(0~5),HBA-lipid(0~5),HBD(0~5),,HY(0~5),,HY-aromatic(0~5),,RA(0~5),得出结果是:
01  RZHHH  Rank 81.939 DH:111111 PH:000000  MaxFit:5
02  RZHHH  Rank 81.939 DH:111111 PH:000000  MaxFit:5
03  RZHHA  Rank 80.739  DH:111111 PH:000000  MaxFit:5
04  RZHHA  Rank 80.739  DH:111111 PH:000000  MaxFit:5
05  RYZHH  Rank 80.673  DH:111111 PH:000000  MaxFit:5
.
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那么做3D QSAR Pharmacophore 时应用什么特征呢?是不是用 R Z H 就可以了?我做出来的置信区间达不到95%,只有90%,而且我的训练集选择的都是较刚性的分子,难道要重新选择吗?

请大家指导一下,不甚感激...
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wafy

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
你参照的教程是什么呢?我做的置信区间也不高,是根据文献然后凭感觉弄得,你有具体的教程没?
2楼2010-10-28 11:44:58
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