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呆米11

金虫 (小有名气)

[交流] 【分享】PCR产物中减少引物二聚体的方法 已有33人参与

1. 从引物自身着手,重新设计引物,这是最根本解决这一问题的办法;
2. 可能模板有问题;
3. 模板浓度过小,适当加大模板量;
4. Taq酶,引物,Mg2+浓度可能过高,可降低它们的浓度;
5. 取你所要加的上下游引物混合后,在100摄氏度下的沸水中煮5分钟,然后迅速拿出至于冰块之上瞬时冷却,这时再加入反应体系当中,引物二聚体就会消失的;
6. 所配MIX中加5%的甘油或者5%的DMSO,可以增强特异性;
7. PCR反应体系的配制在冰上进行,最后加TAq酶,PCR结束后,产物勿放置在室温下过长时间,有人认为室温下有些TAQ酶会将多余的引物合成为二聚体。
8. 增加循环数;
9. 降低退火温度后有条带,则应逐渐提高温度,若提高温度的同时产物量减少,则考虑增加镁离子浓度(根据扩增片断长度而定,片段长则相应镁离子浓度应该高一些);
10. 若降低退火温度,发现还是只有引物二聚体,而且镁离子的浓度在 20-25mmol/l没有区别,则考虑Buffer等试剂没有完全融解、混匀,导致吸取的试剂浓度不对。
11. 以上次的pcr产物作模板二次pcr,可以提高引物与模板的特异性,减少引物二聚体,如果两次时间间隔短的话,可以把原产物稀释100-1000倍,如果间隔较长可以稀释50-100倍
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yebaihe68

新虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我想知道楼主所说的引物二聚体是什么意思?电泳检测,在目的条带较远的地方出现迷糊的拖带,这样算引物二聚体吗?
25楼2010-12-31 11:02:55
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ymzfeng

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流

不错
谢谢分享
5楼2010-07-12 13:34:44
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darcy2010

铜虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
总结得不错,谢谢分享!
Don'tletanyoneputfareintoyou!
7楼2010-07-12 14:34:37
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qiangfeng

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
为什么一定要减少引物二聚体呢?
只要不影响实验结果就行 嘛。。。
顺势而行,问心无愧!
8楼2010-07-12 14:48:44
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